Protein–RNA interactions for Protein: P51910

Apod, Apolipoprotein D, mousemouse

Predictions only

Length 189 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ApodP51910 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ApodP51910 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
ApodP51910 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ApodP51910 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ApodP51910 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ApodP51910 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
ApodP51910 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ApodP51910 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
ApodP51910 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
ApodP51910 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
ApodP51910 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
ApodP51910 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
ApodP51910 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
ApodP51910 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ApodP51910 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
ApodP51910 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
ApodP51910 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ApodP51910 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ApodP51910 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ApodP51910 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
ApodP51910 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
ApodP51910 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
ApodP51910 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ApodP51910 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ApodP51910 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ApodP51910 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ApodP51910 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ApodP51910 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ApodP51910 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ApodP51910 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ApodP51910 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ApodP51910 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
ApodP51910 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ApodP51910 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ApodP51910 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ApodP51910 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ApodP51910 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ApodP51910 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
ApodP51910 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
ApodP51910 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
ApodP51910 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ApodP51910 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
ApodP51910 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
ApodP51910 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ApodP51910 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ApodP51910 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ApodP51910 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ApodP51910 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ApodP51910 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC22.45■■□□□ 1.19
ApodP51910 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
ApodP51910 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ApodP51910 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
ApodP51910 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ApodP51910 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ApodP51910 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
ApodP51910 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
ApodP51910 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
ApodP51910 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ApodP51910 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ApodP51910 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
ApodP51910 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
ApodP51910 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ApodP51910 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ApodP51910 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ApodP51910 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ApodP51910 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ApodP51910 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ApodP51910 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ApodP51910 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ApodP51910 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
ApodP51910 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
ApodP51910 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
ApodP51910 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
ApodP51910 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ApodP51910 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ApodP51910 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ApodP51910 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
ApodP51910 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ApodP51910 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ApodP51910 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ApodP51910 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ApodP51910 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ApodP51910 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ApodP51910 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ApodP51910 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ApodP51910 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ApodP51910 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ApodP51910 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ApodP51910 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ApodP51910 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ApodP51910 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ApodP51910 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ApodP51910 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
ApodP51910 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ApodP51910 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ApodP51910 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ApodP51910 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ApodP51910 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ApodP51910 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ApodP51910 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.9 ms