Protein–RNA interactions for Protein: P50652

Fancc, Fanconi anemia group C protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 591 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FanccP50652 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
FanccP50652 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
FanccP50652 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
FanccP50652 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
FanccP50652 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
FanccP50652 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
FanccP50652 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
FanccP50652 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
FanccP50652 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
FanccP50652 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
FanccP50652 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.51■■■□□ 2
FanccP50652 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
FanccP50652 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
FanccP50652 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
FanccP50652 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
FanccP50652 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
FanccP50652 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
FanccP50652 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
FanccP50652 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
FanccP50652 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
FanccP50652 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
FanccP50652 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
FanccP50652 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
FanccP50652 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
FanccP50652 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
FanccP50652 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
FanccP50652 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
FanccP50652 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
FanccP50652 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
FanccP50652 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
FanccP50652 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
FanccP50652 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
FanccP50652 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
FanccP50652 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
FanccP50652 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
FanccP50652 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
FanccP50652 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
FanccP50652 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
FanccP50652 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
FanccP50652 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
FanccP50652 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
FanccP50652 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
FanccP50652 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
FanccP50652 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
FanccP50652 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
FanccP50652 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
FanccP50652 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
FanccP50652 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
FanccP50652 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
FanccP50652 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
FanccP50652 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
FanccP50652 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
FanccP50652 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
FanccP50652 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
FanccP50652 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
FanccP50652 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
FanccP50652 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
FanccP50652 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
FanccP50652 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
FanccP50652 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC27.33■■□□□ 1.97
FanccP50652 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
FanccP50652 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
FanccP50652 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
FanccP50652 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
FanccP50652 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.3■■□□□ 1.96
FanccP50652 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
FanccP50652 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
FanccP50652 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
FanccP50652 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
FanccP50652 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
FanccP50652 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
FanccP50652 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
FanccP50652 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC27.27■■□□□ 1.96
FanccP50652 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC27.26■■□□□ 1.95
FanccP50652 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
FanccP50652 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
FanccP50652 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
FanccP50652 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC27.23■■□□□ 1.95
FanccP50652 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
FanccP50652 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
FanccP50652 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
FanccP50652 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
FanccP50652 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
FanccP50652 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC27.21■■□□□ 1.95
FanccP50652 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
FanccP50652 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC27.21■■□□□ 1.95
FanccP50652 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
FanccP50652 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.95
FanccP50652 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
FanccP50652 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC27.2■■□□□ 1.94
FanccP50652 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
FanccP50652 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
FanccP50652 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
FanccP50652 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
FanccP50652 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
FanccP50652 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
FanccP50652 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
FanccP50652 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
FanccP50652 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
FanccP50652 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.7 ms