Protein–RNA interactions for Protein: P50608

Fmod, Fibromodulin, mousemouse

Predictions only

Length 376 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FmodP50608 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
FmodP50608 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
FmodP50608 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC18.97■□□□□ 0.63
FmodP50608 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
FmodP50608 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
FmodP50608 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
FmodP50608 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
FmodP50608 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
FmodP50608 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
FmodP50608 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
FmodP50608 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
FmodP50608 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC18.95■□□□□ 0.62
FmodP50608 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
FmodP50608 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
FmodP50608 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
FmodP50608 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
FmodP50608 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
FmodP50608 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
FmodP50608 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
FmodP50608 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
FmodP50608 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
FmodP50608 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
FmodP50608 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
FmodP50608 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
FmodP50608 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
FmodP50608 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
FmodP50608 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
FmodP50608 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
FmodP50608 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
FmodP50608 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
FmodP50608 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
FmodP50608 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
FmodP50608 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
FmodP50608 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
FmodP50608 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
FmodP50608 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
FmodP50608 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
FmodP50608 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
FmodP50608 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
FmodP50608 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
FmodP50608 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
FmodP50608 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.62
FmodP50608 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
FmodP50608 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
FmodP50608 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
FmodP50608 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
FmodP50608 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
FmodP50608 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
FmodP50608 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
FmodP50608 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
FmodP50608 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
FmodP50608 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
FmodP50608 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
FmodP50608 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
FmodP50608 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
FmodP50608 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC18.86■□□□□ 0.61
FmodP50608 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC18.86■□□□□ 0.61
FmodP50608 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
FmodP50608 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
FmodP50608 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
FmodP50608 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
FmodP50608 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
FmodP50608 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
FmodP50608 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
FmodP50608 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
FmodP50608 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
FmodP50608 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
FmodP50608 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
FmodP50608 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
FmodP50608 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
FmodP50608 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
FmodP50608 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
FmodP50608 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
FmodP50608 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
FmodP50608 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
FmodP50608 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
FmodP50608 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
FmodP50608 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
FmodP50608 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
FmodP50608 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
FmodP50608 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
FmodP50608 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
FmodP50608 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC18.81■□□□□ 0.6
FmodP50608 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
FmodP50608 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
FmodP50608 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
FmodP50608 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
FmodP50608 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
FmodP50608 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
FmodP50608 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
FmodP50608 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
FmodP50608 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
FmodP50608 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
FmodP50608 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
FmodP50608 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
FmodP50608 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
FmodP50608 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
FmodP50608 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
FmodP50608 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
FmodP50608 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.3 ms