Protein–RNA interactions for Protein: P50481

Lhx3, LIM/homeobox protein Lhx3, mousemouse

Predictions only

Length 400 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lhx3P50481 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Lhx3P50481 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Lhx3P50481 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Lhx3P50481 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Lhx3P50481 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Lhx3P50481 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Lhx3P50481 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Lhx3P50481 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Lhx3P50481 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Lhx3P50481 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Lhx3P50481 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
Lhx3P50481 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Lhx3P50481 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Lhx3P50481 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Lhx3P50481 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Lhx3P50481 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Lhx3P50481 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Lhx3P50481 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Lhx3P50481 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Lhx3P50481 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Lhx3P50481 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Lhx3P50481 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
Lhx3P50481 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Lhx3P50481 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Lhx3P50481 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Lhx3P50481 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Lhx3P50481 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
Lhx3P50481 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Lhx3P50481 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Lhx3P50481 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Lhx3P50481 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Lhx3P50481 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Lhx3P50481 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Lhx3P50481 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Lhx3P50481 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Lhx3P50481 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Lhx3P50481 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Lhx3P50481 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Lhx3P50481 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Lhx3P50481 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Lhx3P50481 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Lhx3P50481 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Lhx3P50481 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Lhx3P50481 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Lhx3P50481 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Lhx3P50481 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Lhx3P50481 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Lhx3P50481 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Lhx3P50481 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Lhx3P50481 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Lhx3P50481 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Lhx3P50481 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
Lhx3P50481 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Lhx3P50481 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Lhx3P50481 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Lhx3P50481 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
Lhx3P50481 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
Lhx3P50481 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Lhx3P50481 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Lhx3P50481 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Lhx3P50481 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Lhx3P50481 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Lhx3P50481 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
Lhx3P50481 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Lhx3P50481 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Lhx3P50481 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Lhx3P50481 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Lhx3P50481 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Lhx3P50481 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Lhx3P50481 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Lhx3P50481 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Lhx3P50481 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Lhx3P50481 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Lhx3P50481 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.43
Lhx3P50481 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Lhx3P50481 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Lhx3P50481 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Lhx3P50481 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Lhx3P50481 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Lhx3P50481 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Lhx3P50481 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Lhx3P50481 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Lhx3P50481 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Lhx3P50481 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Lhx3P50481 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Lhx3P50481 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
Lhx3P50481 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Lhx3P50481 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Lhx3P50481 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Lhx3P50481 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Lhx3P50481 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Lhx3P50481 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Lhx3P50481 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Lhx3P50481 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Lhx3P50481 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Lhx3P50481 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Lhx3P50481 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Lhx3P50481 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Lhx3P50481 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Lhx3P50481 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 260 ms