Protein–RNA interactions for Protein: P49025

Cit, Citron Rho-interacting kinase, mousemouse

Predictions only

Length 2,055 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CitP49025 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1,59
CitP49025 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC24,99■■□□□ 1,59
CitP49025 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC24,99■■□□□ 1,59
CitP49025 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,99■■□□□ 1,59
CitP49025 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24,98■■□□□ 1,59
CitP49025 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,97■■□□□ 1,59
CitP49025 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,97■■□□□ 1,59
CitP49025 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24,97■■□□□ 1,59
CitP49025 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC24,97■■□□□ 1,59
CitP49025 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC24,95■■□□□ 1,58
CitP49025 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24,95■■□□□ 1,58
CitP49025 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC24,94■■□□□ 1,58
CitP49025 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,93■■□□□ 1,58
CitP49025 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24,92■■□□□ 1,58
CitP49025 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24,92■■□□□ 1,58
CitP49025 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24,92■■□□□ 1,58
CitP49025 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,92■■□□□ 1,58
CitP49025 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24,91■■□□□ 1,58
CitP49025 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC24,91■■□□□ 1,58
CitP49025 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC24,91■■□□□ 1,58
CitP49025 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC24,89■■□□□ 1,58
CitP49025 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,89■■□□□ 1,58
CitP49025 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24,89■■□□□ 1,57
CitP49025 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,88■■□□□ 1,57
CitP49025 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24,87■■□□□ 1,57
CitP49025 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24,87■■□□□ 1,57
CitP49025 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,87■■□□□ 1,57
CitP49025 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC24,87■■□□□ 1,57
CitP49025 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC24,87■■□□□ 1,57
CitP49025 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,86■■□□□ 1,57
CitP49025 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC24,86■■□□□ 1,57
CitP49025 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,86■■□□□ 1,57
CitP49025 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC24,85■■□□□ 1,57
CitP49025 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC24,85■■□□□ 1,57
CitP49025 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24,85■■□□□ 1,57
CitP49025 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC24,84■■□□□ 1,57
CitP49025 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC24,84■■□□□ 1,57
CitP49025 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,83■■□□□ 1,57
CitP49025 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC24,83■■□□□ 1,57
CitP49025 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC24,83■■□□□ 1,57
CitP49025 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,83■■□□□ 1,57
CitP49025 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24,83■■□□□ 1,56
CitP49025 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC24,82■■□□□ 1,56
CitP49025 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,82■■□□□ 1,56
CitP49025 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,82■■□□□ 1,56
CitP49025 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC24,82■■□□□ 1,56
CitP49025 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,82■■□□□ 1,56
CitP49025 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24,82■■□□□ 1,56
CitP49025 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC24,81■■□□□ 1,56
CitP49025 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,81■■□□□ 1,56
CitP49025 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC24,81■■□□□ 1,56
CitP49025 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,81■■□□□ 1,56
CitP49025 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24,8■■□□□ 1,56
CitP49025 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,8■■□□□ 1,56
CitP49025 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24,8■■□□□ 1,56
CitP49025 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24,8■■□□□ 1,56
CitP49025 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,8■■□□□ 1,56
CitP49025 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24,8■■□□□ 1,56
CitP49025 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,8■■□□□ 1,56
CitP49025 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC24,8■■□□□ 1,56
CitP49025 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC24,79■■□□□ 1,56
CitP49025 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC24,78■■□□□ 1,56
CitP49025 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,78■■□□□ 1,56
CitP49025 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24,77■■□□□ 1,56
CitP49025 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC24,77■■□□□ 1,56
CitP49025 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24,76■■□□□ 1,55
CitP49025 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC24,76■■□□□ 1,55
CitP49025 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC24,76■■□□□ 1,55
CitP49025 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24,76■■□□□ 1,55
CitP49025 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,76■■□□□ 1,55
CitP49025 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,76■■□□□ 1,55
CitP49025 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,75■■□□□ 1,55
CitP49025 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,75■■□□□ 1,55
CitP49025 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC24,75■■□□□ 1,55
CitP49025 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC24,74■■□□□ 1,55
CitP49025 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC24,74■■□□□ 1,55
CitP49025 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24,74■■□□□ 1,55
CitP49025 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,74■■□□□ 1,55
CitP49025 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24,73■■□□□ 1,55
CitP49025 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24,72■■□□□ 1,55
CitP49025 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24,72■■□□□ 1,55
CitP49025 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,67■■□□□ 1,54
CitP49025 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC24,66■■□□□ 1,54
CitP49025 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24,66■■□□□ 1,54
CitP49025 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC24,65■■□□□ 1,54
CitP49025 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC24,65■■□□□ 1,54
CitP49025 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,65■■□□□ 1,54
CitP49025 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,65■■□□□ 1,54
CitP49025 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC24,64■■□□□ 1,53
CitP49025 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,63■■□□□ 1,53
CitP49025 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24,63■■□□□ 1,53
CitP49025 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,63■■□□□ 1,53
CitP49025 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,62■■□□□ 1,53
CitP49025 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,61■■□□□ 1,53
CitP49025 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,6■■□□□ 1,53
CitP49025 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24,59■■□□□ 1,53
CitP49025 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,59■■□□□ 1,53
CitP49025 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24,58■■□□□ 1,53
CitP49025 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,58■■□□□ 1,53
CitP49025 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC24,58■■□□□ 1,53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11 ms