Protein–RNA interactions for Protein: P49025

Cit, Citron Rho-interacting kinase, mousemouse

Predictions only

Length 2,055 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CitP49025 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
CitP49025 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CitP49025 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
CitP49025 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CitP49025 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CitP49025 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CitP49025 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CitP49025 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CitP49025 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CitP49025 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CitP49025 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CitP49025 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CitP49025 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CitP49025 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CitP49025 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CitP49025 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CitP49025 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CitP49025 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CitP49025 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CitP49025 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CitP49025 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
CitP49025 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
CitP49025 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
CitP49025 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CitP49025 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CitP49025 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CitP49025 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CitP49025 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CitP49025 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CitP49025 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CitP49025 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CitP49025 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CitP49025 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CitP49025 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
CitP49025 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CitP49025 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CitP49025 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CitP49025 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CitP49025 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CitP49025 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
CitP49025 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CitP49025 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
CitP49025 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CitP49025 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CitP49025 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CitP49025 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
CitP49025 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CitP49025 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CitP49025 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CitP49025 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CitP49025 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CitP49025 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CitP49025 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CitP49025 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CitP49025 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CitP49025 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CitP49025 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CitP49025 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CitP49025 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CitP49025 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CitP49025 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CitP49025 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CitP49025 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CitP49025 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CitP49025 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
CitP49025 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CitP49025 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CitP49025 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CitP49025 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CitP49025 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CitP49025 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CitP49025 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CitP49025 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CitP49025 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CitP49025 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
CitP49025 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
CitP49025 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CitP49025 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CitP49025 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CitP49025 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CitP49025 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CitP49025 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CitP49025 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
CitP49025 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CitP49025 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CitP49025 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CitP49025 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CitP49025 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CitP49025 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
CitP49025 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CitP49025 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CitP49025 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CitP49025 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CitP49025 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CitP49025 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CitP49025 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CitP49025 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CitP49025 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CitP49025 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CitP49025 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.7 ms