Protein–RNA interactions for Protein: P48985

Atoh1, Protein atonal homolog 1, mousemouse

Predictions only

Length 351 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atoh1P48985 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
Atoh1P48985 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC27.55■■■□□ 2
Atoh1P48985 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Atoh1P48985 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
Atoh1P48985 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Atoh1P48985 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC27.53■■■□□ 2
Atoh1P48985 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Atoh1P48985 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC27.52■■■□□ 2
Atoh1P48985 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Atoh1P48985 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Atoh1P48985 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
Atoh1P48985 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Atoh1P48985 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Atoh1P48985 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Atoh1P48985 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Atoh1P48985 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Atoh1P48985 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Atoh1P48985 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
Atoh1P48985 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Atoh1P48985 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
Atoh1P48985 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Atoh1P48985 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Atoh1P48985 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Atoh1P48985 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Atoh1P48985 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Atoh1P48985 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
Atoh1P48985 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC27.43■■□□□ 1.98
Atoh1P48985 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Atoh1P48985 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Atoh1P48985 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Atoh1P48985 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Atoh1P48985 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
Atoh1P48985 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Atoh1P48985 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Atoh1P48985 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
Atoh1P48985 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Atoh1P48985 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Atoh1P48985 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Atoh1P48985 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Atoh1P48985 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
Atoh1P48985 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
Atoh1P48985 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
Atoh1P48985 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Atoh1P48985 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Atoh1P48985 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
Atoh1P48985 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
Atoh1P48985 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Atoh1P48985 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
Atoh1P48985 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Atoh1P48985 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
Atoh1P48985 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Atoh1P48985 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Atoh1P48985 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
Atoh1P48985 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Atoh1P48985 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
Atoh1P48985 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC27.31■■□□□ 1.96
Atoh1P48985 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
Atoh1P48985 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Atoh1P48985 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC27.28■■□□□ 1.96
Atoh1P48985 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Atoh1P48985 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
Atoh1P48985 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
Atoh1P48985 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Atoh1P48985 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Atoh1P48985 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Atoh1P48985 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Atoh1P48985 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Atoh1P48985 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC27.24■■□□□ 1.95
Atoh1P48985 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
Atoh1P48985 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Atoh1P48985 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Atoh1P48985 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
Atoh1P48985 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Atoh1P48985 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Atoh1P48985 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Atoh1P48985 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
Atoh1P48985 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Atoh1P48985 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
Atoh1P48985 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC27.21■■□□□ 1.95
Atoh1P48985 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Atoh1P48985 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Atoh1P48985 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Atoh1P48985 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
Atoh1P48985 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
Atoh1P48985 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
Atoh1P48985 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Atoh1P48985 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Atoh1P48985 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Atoh1P48985 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Atoh1P48985 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Atoh1P48985 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
Atoh1P48985 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Atoh1P48985 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Atoh1P48985 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Atoh1P48985 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
Atoh1P48985 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Atoh1P48985 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Atoh1P48985 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Atoh1P48985 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Atoh1P48985 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 146.8 ms