Protein–RNA interactions for Protein: P48772

Cox8b, Cytochrome c oxidase subunit 8B, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 70 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cox8bP48772 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Cox8bP48772 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Cox8bP48772 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Cox8bP48772 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Cox8bP48772 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Cox8bP48772 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Cox8bP48772 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Cox8bP48772 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Cox8bP48772 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Cox8bP48772 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Cox8bP48772 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Cox8bP48772 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cox8bP48772 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cox8bP48772 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cox8bP48772 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cox8bP48772 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Cox8bP48772 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Cox8bP48772 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Cox8bP48772 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cox8bP48772 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cox8bP48772 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cox8bP48772 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cox8bP48772 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cox8bP48772 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cox8bP48772 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cox8bP48772 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cox8bP48772 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cox8bP48772 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cox8bP48772 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cox8bP48772 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cox8bP48772 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cox8bP48772 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Cox8bP48772 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Cox8bP48772 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Cox8bP48772 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Cox8bP48772 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Cox8bP48772 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
Cox8bP48772 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Cox8bP48772 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Cox8bP48772 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Cox8bP48772 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Cox8bP48772 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Cox8bP48772 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Cox8bP48772 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Cox8bP48772 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Cox8bP48772 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Cox8bP48772 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Cox8bP48772 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Cox8bP48772 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Cox8bP48772 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Cox8bP48772 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Cox8bP48772 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Cox8bP48772 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Cox8bP48772 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Cox8bP48772 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Cox8bP48772 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Cox8bP48772 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Cox8bP48772 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Cox8bP48772 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Cox8bP48772 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Cox8bP48772 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Cox8bP48772 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Cox8bP48772 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Cox8bP48772 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Cox8bP48772 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Cox8bP48772 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Cox8bP48772 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Cox8bP48772 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Cox8bP48772 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Cox8bP48772 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Cox8bP48772 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Cox8bP48772 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Cox8bP48772 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Cox8bP48772 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Cox8bP48772 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Cox8bP48772 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Cox8bP48772 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Cox8bP48772 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Cox8bP48772 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Cox8bP48772 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Cox8bP48772 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Cox8bP48772 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Cox8bP48772 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Cox8bP48772 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Cox8bP48772 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Cox8bP48772 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Cox8bP48772 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Cox8bP48772 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Cox8bP48772 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Cox8bP48772 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Cox8bP48772 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Cox8bP48772 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Cox8bP48772 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Cox8bP48772 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Cox8bP48772 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Cox8bP48772 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Cox8bP48772 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Cox8bP48772 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Cox8bP48772 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Cox8bP48772 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66.4 ms