Protein–RNA interactions for Protein: P47963

Rpl13, 60S ribosomal protein L13, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 211 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl13P47963 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Rpl13P47963 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Rpl13P47963 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Rpl13P47963 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Rpl13P47963 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Rpl13P47963 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Rpl13P47963 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Rpl13P47963 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Rpl13P47963 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Rpl13P47963 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Rpl13P47963 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Rpl13P47963 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Rpl13P47963 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Rpl13P47963 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Rpl13P47963 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Rpl13P47963 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Rpl13P47963 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Rpl13P47963 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC25.76■■□□□ 1.71
Rpl13P47963 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Rpl13P47963 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
Rpl13P47963 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
Rpl13P47963 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Rpl13P47963 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Rpl13P47963 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Rpl13P47963 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Rpl13P47963 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Rpl13P47963 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Rpl13P47963 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
Rpl13P47963 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Rpl13P47963 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Rpl13P47963 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Rpl13P47963 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Rpl13P47963 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Rpl13P47963 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
Rpl13P47963 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Rpl13P47963 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Rpl13P47963 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Rpl13P47963 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Rpl13P47963 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Rpl13P47963 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Rpl13P47963 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Rpl13P47963 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
Rpl13P47963 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Rpl13P47963 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Rpl13P47963 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Rpl13P47963 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Rpl13P47963 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Rpl13P47963 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
Rpl13P47963 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
Rpl13P47963 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Rpl13P47963 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Rpl13P47963 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Rpl13P47963 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Rpl13P47963 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Rpl13P47963 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Rpl13P47963 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Rpl13P47963 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
Rpl13P47963 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
Rpl13P47963 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
Rpl13P47963 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
Rpl13P47963 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
Rpl13P47963 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Rpl13P47963 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Rpl13P47963 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Rpl13P47963 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
Rpl13P47963 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Rpl13P47963 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Rpl13P47963 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Rpl13P47963 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Rpl13P47963 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Rpl13P47963 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Rpl13P47963 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Rpl13P47963 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Rpl13P47963 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Rpl13P47963 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Rpl13P47963 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Rpl13P47963 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Rpl13P47963 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Rpl13P47963 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Rpl13P47963 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Rpl13P47963 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Rpl13P47963 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Rpl13P47963 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Rpl13P47963 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Rpl13P47963 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Rpl13P47963 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Rpl13P47963 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Rpl13P47963 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Rpl13P47963 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Rpl13P47963 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Rpl13P47963 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Rpl13P47963 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Rpl13P47963 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Rpl13P47963 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Rpl13P47963 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Rpl13P47963 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Rpl13P47963 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Rpl13P47963 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Rpl13P47963 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Rpl13P47963 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 71.4 ms