Protein–RNA interactions for Protein: P46660

Ina, Alpha-internexin, mousemouse

Predictions only

Length 501 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
InaP46660 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
InaP46660 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
InaP46660 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
InaP46660 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
InaP46660 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
InaP46660 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
InaP46660 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
InaP46660 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
InaP46660 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
InaP46660 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
InaP46660 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
InaP46660 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
InaP46660 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
InaP46660 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
InaP46660 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
InaP46660 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
InaP46660 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
InaP46660 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
InaP46660 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
InaP46660 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
InaP46660 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
InaP46660 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
InaP46660 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
InaP46660 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
InaP46660 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
InaP46660 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
InaP46660 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
InaP46660 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
InaP46660 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
InaP46660 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
InaP46660 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
InaP46660 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
InaP46660 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
InaP46660 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
InaP46660 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
InaP46660 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
InaP46660 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
InaP46660 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
InaP46660 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
InaP46660 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
InaP46660 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
InaP46660 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
InaP46660 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
InaP46660 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
InaP46660 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
InaP46660 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
InaP46660 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
InaP46660 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
InaP46660 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
InaP46660 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
InaP46660 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
InaP46660 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
InaP46660 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
InaP46660 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
InaP46660 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
InaP46660 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
InaP46660 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
InaP46660 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
InaP46660 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
InaP46660 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
InaP46660 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
InaP46660 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC22■■□□□ 1.11
InaP46660 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
InaP46660 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
InaP46660 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
InaP46660 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
InaP46660 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
InaP46660 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
InaP46660 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
InaP46660 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
InaP46660 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
InaP46660 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
InaP46660 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
InaP46660 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
InaP46660 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
InaP46660 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
InaP46660 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
InaP46660 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
InaP46660 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
InaP46660 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
InaP46660 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
InaP46660 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
InaP46660 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
InaP46660 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
InaP46660 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
InaP46660 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
InaP46660 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
InaP46660 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
InaP46660 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
InaP46660 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
InaP46660 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
InaP46660 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
InaP46660 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
InaP46660 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
InaP46660 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
InaP46660 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
InaP46660 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
InaP46660 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
InaP46660 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
InaP46660 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC21.89■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.1 ms