Protein–RNA interactions for Protein: P43025

Clec3b, Tetranectin, mousemouse

Predictions only

Length 202 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clec3bP43025 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Clec3bP43025 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Clec3bP43025 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Clec3bP43025 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Clec3bP43025 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Clec3bP43025 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Clec3bP43025 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Clec3bP43025 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Clec3bP43025 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Clec3bP43025 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Clec3bP43025 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Clec3bP43025 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Clec3bP43025 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Clec3bP43025 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Clec3bP43025 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Clec3bP43025 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Clec3bP43025 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Clec3bP43025 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Clec3bP43025 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Clec3bP43025 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
Clec3bP43025 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Clec3bP43025 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Clec3bP43025 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Clec3bP43025 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Clec3bP43025 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Clec3bP43025 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Clec3bP43025 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Clec3bP43025 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Clec3bP43025 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Clec3bP43025 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Clec3bP43025 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Clec3bP43025 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Clec3bP43025 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Clec3bP43025 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Clec3bP43025 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Clec3bP43025 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Clec3bP43025 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Clec3bP43025 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Clec3bP43025 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Clec3bP43025 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Clec3bP43025 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Clec3bP43025 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Clec3bP43025 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Clec3bP43025 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Clec3bP43025 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Clec3bP43025 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Clec3bP43025 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Clec3bP43025 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Clec3bP43025 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Clec3bP43025 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Clec3bP43025 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Clec3bP43025 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Clec3bP43025 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Clec3bP43025 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Clec3bP43025 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Clec3bP43025 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Clec3bP43025 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Clec3bP43025 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Clec3bP43025 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Clec3bP43025 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Clec3bP43025 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Clec3bP43025 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Clec3bP43025 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Clec3bP43025 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Clec3bP43025 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Clec3bP43025 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Clec3bP43025 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Clec3bP43025 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Clec3bP43025 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Clec3bP43025 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Clec3bP43025 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Clec3bP43025 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Clec3bP43025 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Clec3bP43025 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Clec3bP43025 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Clec3bP43025 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Clec3bP43025 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Clec3bP43025 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Clec3bP43025 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Clec3bP43025 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Clec3bP43025 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Clec3bP43025 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Clec3bP43025 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Clec3bP43025 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Clec3bP43025 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Clec3bP43025 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Clec3bP43025 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Clec3bP43025 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Clec3bP43025 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Clec3bP43025 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Clec3bP43025 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Clec3bP43025 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Clec3bP43025 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Clec3bP43025 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.79
Clec3bP43025 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Clec3bP43025 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Clec3bP43025 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Clec3bP43025 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Clec3bP43025 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC20■□□□□ 0.79
Clec3bP43025 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.8 ms