Protein–RNA interactions for Protein: P41731

Cd63, CD63 antigen, mousemouse

Predictions only

Length 238 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd63P41731 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Cd63P41731 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Cd63P41731 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Cd63P41731 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Cd63P41731 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Cd63P41731 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Cd63P41731 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Cd63P41731 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Cd63P41731 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Cd63P41731 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Cd63P41731 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Cd63P41731 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Cd63P41731 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Cd63P41731 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Cd63P41731 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Cd63P41731 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Cd63P41731 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Cd63P41731 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Cd63P41731 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Cd63P41731 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Cd63P41731 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Cd63P41731 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Cd63P41731 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Cd63P41731 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Cd63P41731 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Cd63P41731 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Cd63P41731 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Cd63P41731 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Cd63P41731 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Cd63P41731 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Cd63P41731 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Cd63P41731 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Cd63P41731 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Cd63P41731 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Cd63P41731 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Cd63P41731 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Cd63P41731 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Cd63P41731 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Cd63P41731 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Cd63P41731 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Cd63P41731 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Cd63P41731 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Cd63P41731 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Cd63P41731 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Cd63P41731 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Cd63P41731 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Cd63P41731 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Cd63P41731 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Cd63P41731 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Cd63P41731 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Cd63P41731 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Cd63P41731 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Cd63P41731 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Cd63P41731 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Cd63P41731 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Cd63P41731 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Cd63P41731 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Cd63P41731 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Cd63P41731 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Cd63P41731 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Cd63P41731 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Cd63P41731 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Cd63P41731 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Cd63P41731 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Cd63P41731 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Cd63P41731 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Cd63P41731 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Cd63P41731 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Cd63P41731 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Cd63P41731 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Cd63P41731 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Cd63P41731 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Cd63P41731 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Cd63P41731 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Cd63P41731 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Cd63P41731 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Cd63P41731 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Cd63P41731 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
Cd63P41731 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Cd63P41731 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Cd63P41731 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Cd63P41731 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Cd63P41731 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cd63P41731 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cd63P41731 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Cd63P41731 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Cd63P41731 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Cd63P41731 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Cd63P41731 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Cd63P41731 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Cd63P41731 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Cd63P41731 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Cd63P41731 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Cd63P41731 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Cd63P41731 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cd63P41731 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cd63P41731 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cd63P41731 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cd63P41731 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cd63P41731 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.4 ms