Protein–RNA interactions for Protein: P41274

Tnfsf9, Tumor necrosis factor ligand superfamily member 9, mousemouse

Predictions only

Length 309 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfsf9P41274 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Tnfsf9P41274 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Tnfsf9P41274 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Tnfsf9P41274 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Tnfsf9P41274 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Tnfsf9P41274 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Tnfsf9P41274 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Tnfsf9P41274 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Tnfsf9P41274 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Tnfsf9P41274 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Tnfsf9P41274 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Tnfsf9P41274 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Tnfsf9P41274 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Tnfsf9P41274 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Tnfsf9P41274 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Tnfsf9P41274 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Tnfsf9P41274 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Tnfsf9P41274 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Tnfsf9P41274 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Tnfsf9P41274 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Tnfsf9P41274 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Tnfsf9P41274 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Tnfsf9P41274 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Tnfsf9P41274 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Tnfsf9P41274 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Tnfsf9P41274 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
Tnfsf9P41274 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Tnfsf9P41274 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Tnfsf9P41274 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Tnfsf9P41274 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Tnfsf9P41274 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
Tnfsf9P41274 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Tnfsf9P41274 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Tnfsf9P41274 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Tnfsf9P41274 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Tnfsf9P41274 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Tnfsf9P41274 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Tnfsf9P41274 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Tnfsf9P41274 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
Tnfsf9P41274 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Tnfsf9P41274 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Tnfsf9P41274 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Tnfsf9P41274 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Tnfsf9P41274 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Tnfsf9P41274 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Tnfsf9P41274 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Tnfsf9P41274 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Tnfsf9P41274 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Tnfsf9P41274 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Tnfsf9P41274 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Tnfsf9P41274 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Tnfsf9P41274 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Tnfsf9P41274 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Tnfsf9P41274 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Tnfsf9P41274 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Tnfsf9P41274 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Tnfsf9P41274 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Tnfsf9P41274 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Tnfsf9P41274 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Tnfsf9P41274 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Tnfsf9P41274 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Tnfsf9P41274 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Tnfsf9P41274 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Tnfsf9P41274 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Tnfsf9P41274 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Tnfsf9P41274 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Tnfsf9P41274 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Tnfsf9P41274 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Tnfsf9P41274 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Tnfsf9P41274 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Tnfsf9P41274 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Tnfsf9P41274 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Tnfsf9P41274 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Tnfsf9P41274 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Tnfsf9P41274 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Tnfsf9P41274 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Tnfsf9P41274 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Tnfsf9P41274 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Tnfsf9P41274 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Tnfsf9P41274 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Tnfsf9P41274 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Tnfsf9P41274 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Tnfsf9P41274 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Tnfsf9P41274 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Tnfsf9P41274 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Tnfsf9P41274 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Tnfsf9P41274 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Tnfsf9P41274 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Tnfsf9P41274 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Tnfsf9P41274 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Tnfsf9P41274 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Tnfsf9P41274 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
Tnfsf9P41274 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
Tnfsf9P41274 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Tnfsf9P41274 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Tnfsf9P41274 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Tnfsf9P41274 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Tnfsf9P41274 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Tnfsf9P41274 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Tnfsf9P41274 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 78.8 ms