Protein–RNA interactions for Protein: P40630

Tfam, Transcription factor A, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 243 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TfamP40630 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TfamP40630 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TfamP40630 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TfamP40630 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TfamP40630 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TfamP40630 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TfamP40630 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TfamP40630 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
TfamP40630 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TfamP40630 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TfamP40630 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
TfamP40630 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TfamP40630 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TfamP40630 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TfamP40630 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TfamP40630 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TfamP40630 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TfamP40630 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TfamP40630 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TfamP40630 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TfamP40630 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TfamP40630 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TfamP40630 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
TfamP40630 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TfamP40630 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
TfamP40630 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TfamP40630 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
TfamP40630 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TfamP40630 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
TfamP40630 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
TfamP40630 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TfamP40630 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TfamP40630 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TfamP40630 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
TfamP40630 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TfamP40630 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TfamP40630 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
TfamP40630 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TfamP40630 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
TfamP40630 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TfamP40630 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
TfamP40630 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TfamP40630 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TfamP40630 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TfamP40630 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TfamP40630 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TfamP40630 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TfamP40630 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
TfamP40630 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
TfamP40630 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
TfamP40630 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
TfamP40630 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
TfamP40630 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
TfamP40630 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TfamP40630 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TfamP40630 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TfamP40630 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TfamP40630 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TfamP40630 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TfamP40630 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TfamP40630 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TfamP40630 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
TfamP40630 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TfamP40630 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
TfamP40630 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TfamP40630 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TfamP40630 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TfamP40630 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TfamP40630 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
TfamP40630 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TfamP40630 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TfamP40630 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
TfamP40630 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TfamP40630 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TfamP40630 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TfamP40630 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TfamP40630 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TfamP40630 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TfamP40630 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TfamP40630 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TfamP40630 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TfamP40630 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TfamP40630 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TfamP40630 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TfamP40630 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TfamP40630 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TfamP40630 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TfamP40630 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TfamP40630 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TfamP40630 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TfamP40630 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TfamP40630 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
TfamP40630 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
TfamP40630 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TfamP40630 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TfamP40630 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TfamP40630 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TfamP40630 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TfamP40630 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TfamP40630 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.4 ms