Protein–RNA interactions for Protein: P40240

Cd9, CD9 antigen, mousemouse

Predictions only

Length 226 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd9P40240 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Cd9P40240 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Cd9P40240 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Cd9P40240 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Cd9P40240 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Cd9P40240 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Cd9P40240 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
Cd9P40240 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
Cd9P40240 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Cd9P40240 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Cd9P40240 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Cd9P40240 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Cd9P40240 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Cd9P40240 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Cd9P40240 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Cd9P40240 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
Cd9P40240 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Cd9P40240 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Cd9P40240 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Cd9P40240 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Cd9P40240 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Cd9P40240 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Cd9P40240 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Cd9P40240 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Cd9P40240 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Cd9P40240 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Cd9P40240 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Cd9P40240 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
Cd9P40240 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
Cd9P40240 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
Cd9P40240 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Cd9P40240 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Cd9P40240 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Cd9P40240 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Cd9P40240 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Cd9P40240 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Cd9P40240 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Cd9P40240 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Cd9P40240 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Cd9P40240 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Cd9P40240 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
Cd9P40240 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Cd9P40240 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Cd9P40240 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Cd9P40240 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Cd9P40240 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Cd9P40240 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Cd9P40240 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Cd9P40240 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Cd9P40240 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Cd9P40240 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Cd9P40240 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Cd9P40240 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Cd9P40240 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Cd9P40240 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Cd9P40240 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Cd9P40240 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Cd9P40240 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
Cd9P40240 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Cd9P40240 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Cd9P40240 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Cd9P40240 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Cd9P40240 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Cd9P40240 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Cd9P40240 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Cd9P40240 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Cd9P40240 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
Cd9P40240 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Cd9P40240 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Cd9P40240 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Cd9P40240 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
Cd9P40240 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Cd9P40240 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Cd9P40240 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Cd9P40240 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Cd9P40240 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Cd9P40240 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Cd9P40240 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Cd9P40240 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Cd9P40240 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Cd9P40240 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Cd9P40240 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Cd9P40240 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Cd9P40240 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Cd9P40240 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Cd9P40240 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Cd9P40240 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Cd9P40240 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Cd9P40240 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Cd9P40240 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Cd9P40240 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Cd9P40240 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Cd9P40240 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Cd9P40240 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Cd9P40240 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Cd9P40240 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Cd9P40240 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Cd9P40240 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Cd9P40240 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Cd9P40240 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.6 ms