Protein–RNA interactions for Protein: P35285

Rab22a, Ras-related protein Rab-22A, mousemouse

Predictions only

Length 194 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab22aP35285 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Rab22aP35285 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Rab22aP35285 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Rab22aP35285 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Rab22aP35285 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Rab22aP35285 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Rab22aP35285 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Rab22aP35285 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Rab22aP35285 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
Rab22aP35285 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Rab22aP35285 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Rab22aP35285 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Rab22aP35285 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Rab22aP35285 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Rab22aP35285 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Rab22aP35285 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Rab22aP35285 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Rab22aP35285 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Rab22aP35285 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Rab22aP35285 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Rab22aP35285 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Rab22aP35285 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Rab22aP35285 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Rab22aP35285 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Rab22aP35285 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Rab22aP35285 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Rab22aP35285 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Rab22aP35285 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Rab22aP35285 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Rab22aP35285 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Rab22aP35285 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Rab22aP35285 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Rab22aP35285 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Rab22aP35285 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Rab22aP35285 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Rab22aP35285 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Rab22aP35285 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Rab22aP35285 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Rab22aP35285 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Rab22aP35285 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Rab22aP35285 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Rab22aP35285 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Rab22aP35285 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Rab22aP35285 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Rab22aP35285 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Rab22aP35285 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Rab22aP35285 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Rab22aP35285 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Rab22aP35285 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Rab22aP35285 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Rab22aP35285 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Rab22aP35285 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Rab22aP35285 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Rab22aP35285 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Rab22aP35285 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Rab22aP35285 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Rab22aP35285 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Rab22aP35285 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Rab22aP35285 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Rab22aP35285 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Rab22aP35285 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Rab22aP35285 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Rab22aP35285 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Rab22aP35285 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Rab22aP35285 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Rab22aP35285 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Rab22aP35285 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Rab22aP35285 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Rab22aP35285 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Rab22aP35285 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Rab22aP35285 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Rab22aP35285 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Rab22aP35285 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Rab22aP35285 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
Rab22aP35285 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Rab22aP35285 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Rab22aP35285 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Rab22aP35285 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Rab22aP35285 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Rab22aP35285 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Rab22aP35285 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Rab22aP35285 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Rab22aP35285 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Rab22aP35285 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Rab22aP35285 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Rab22aP35285 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Rab22aP35285 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Rab22aP35285 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Rab22aP35285 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Rab22aP35285 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Rab22aP35285 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Rab22aP35285 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
Rab22aP35285 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Rab22aP35285 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Rab22aP35285 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.79
Rab22aP35285 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Rab22aP35285 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Rab22aP35285 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Rab22aP35285 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Rab22aP35285 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 907.2 ms