Protein–RNA interactions for Protein: P34152

Ptk2, Focal adhesion kinase 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,090 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptk2P34152 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Ptk2P34152 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Ptk2P34152 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Ptk2P34152 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Ptk2P34152 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Ptk2P34152 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Ptk2P34152 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Ptk2P34152 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Ptk2P34152 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Ptk2P34152 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Ptk2P34152 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Ptk2P34152 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Ptk2P34152 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Ptk2P34152 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Ptk2P34152 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Ptk2P34152 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Ptk2P34152 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Ptk2P34152 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Ptk2P34152 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Ptk2P34152 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Ptk2P34152 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Ptk2P34152 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Ptk2P34152 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Ptk2P34152 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Ptk2P34152 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Ptk2P34152 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC24.64■■□□□ 1.53
Ptk2P34152 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Ptk2P34152 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Ptk2P34152 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Ptk2P34152 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Ptk2P34152 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Ptk2P34152 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Ptk2P34152 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Ptk2P34152 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Ptk2P34152 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Ptk2P34152 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Ptk2P34152 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
Ptk2P34152 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Ptk2P34152 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Ptk2P34152 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Ptk2P34152 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Ptk2P34152 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Ptk2P34152 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Ptk2P34152 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Ptk2P34152 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Ptk2P34152 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Ptk2P34152 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
Ptk2P34152 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Ptk2P34152 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Ptk2P34152 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Ptk2P34152 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Ptk2P34152 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Ptk2P34152 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Ptk2P34152 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Ptk2P34152 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Ptk2P34152 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Ptk2P34152 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Ptk2P34152 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Ptk2P34152 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Ptk2P34152 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Ptk2P34152 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Ptk2P34152 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
Ptk2P34152 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
Ptk2P34152 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Ptk2P34152 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Ptk2P34152 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
Ptk2P34152 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Ptk2P34152 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Ptk2P34152 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Ptk2P34152 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Ptk2P34152 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Ptk2P34152 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Ptk2P34152 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
Ptk2P34152 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Ptk2P34152 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Ptk2P34152 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Ptk2P34152 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Ptk2P34152 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Ptk2P34152 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Ptk2P34152 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Ptk2P34152 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Ptk2P34152 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Ptk2P34152 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Ptk2P34152 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Ptk2P34152 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Ptk2P34152 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Ptk2P34152 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
Ptk2P34152 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Ptk2P34152 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Ptk2P34152 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Ptk2P34152 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Ptk2P34152 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Ptk2P34152 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Ptk2P34152 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Ptk2P34152 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Ptk2P34152 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Ptk2P34152 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Ptk2P34152 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Ptk2P34152 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Ptk2P34152 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.9 ms