Protein–RNA interactions for Protein: P33611

Pola2, DNA polymerase alpha subunit B, mousemouse

Predictions only

Length 600 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pola2P33611 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Pola2P33611 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Pola2P33611 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Pola2P33611 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Pola2P33611 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Pola2P33611 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Pola2P33611 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Pola2P33611 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Pola2P33611 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Pola2P33611 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Pola2P33611 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Pola2P33611 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Pola2P33611 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Pola2P33611 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Pola2P33611 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Pola2P33611 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Pola2P33611 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Pola2P33611 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Pola2P33611 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Pola2P33611 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Pola2P33611 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Pola2P33611 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Pola2P33611 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Pola2P33611 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Pola2P33611 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Pola2P33611 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Pola2P33611 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Pola2P33611 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Pola2P33611 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Pola2P33611 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Pola2P33611 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Pola2P33611 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Pola2P33611 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Pola2P33611 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Pola2P33611 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Pola2P33611 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Pola2P33611 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Pola2P33611 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Pola2P33611 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Pola2P33611 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Pola2P33611 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Pola2P33611 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Pola2P33611 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Pola2P33611 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Pola2P33611 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Pola2P33611 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Pola2P33611 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
Pola2P33611 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Pola2P33611 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Pola2P33611 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Pola2P33611 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Pola2P33611 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Pola2P33611 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Pola2P33611 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Pola2P33611 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Pola2P33611 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Pola2P33611 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Pola2P33611 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Pola2P33611 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Pola2P33611 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Pola2P33611 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Pola2P33611 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Pola2P33611 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Pola2P33611 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Pola2P33611 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Pola2P33611 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Pola2P33611 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Pola2P33611 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Pola2P33611 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Pola2P33611 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Pola2P33611 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Pola2P33611 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Pola2P33611 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Pola2P33611 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Pola2P33611 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Pola2P33611 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Pola2P33611 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Pola2P33611 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
Pola2P33611 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Pola2P33611 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Pola2P33611 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Pola2P33611 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Pola2P33611 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Pola2P33611 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Pola2P33611 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Pola2P33611 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
Pola2P33611 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Pola2P33611 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Pola2P33611 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Pola2P33611 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Pola2P33611 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
Pola2P33611 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Pola2P33611 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Pola2P33611 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Pola2P33611 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Pola2P33611 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Pola2P33611 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Pola2P33611 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.6
Pola2P33611 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.6
Pola2P33611 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67.5 ms