Protein–RNA interactions for Protein: P33610

Prim2, DNA primase large subunit, mousemouse

Predictions only

Length 505 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prim2P33610 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Prim2P33610 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Prim2P33610 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Prim2P33610 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Prim2P33610 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Prim2P33610 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Prim2P33610 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Prim2P33610 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Prim2P33610 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Prim2P33610 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Prim2P33610 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Prim2P33610 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Prim2P33610 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Prim2P33610 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Prim2P33610 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Prim2P33610 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Prim2P33610 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Prim2P33610 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Prim2P33610 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Prim2P33610 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
Prim2P33610 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Prim2P33610 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Prim2P33610 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Prim2P33610 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Prim2P33610 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Prim2P33610 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Prim2P33610 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Prim2P33610 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Prim2P33610 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Prim2P33610 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Prim2P33610 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Prim2P33610 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Prim2P33610 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Prim2P33610 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Prim2P33610 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Prim2P33610 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Prim2P33610 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
Prim2P33610 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Prim2P33610 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Prim2P33610 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Prim2P33610 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Prim2P33610 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC22.89■■□□□ 1.26
Prim2P33610 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Prim2P33610 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Prim2P33610 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Prim2P33610 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
Prim2P33610 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Prim2P33610 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Prim2P33610 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Prim2P33610 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Prim2P33610 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Prim2P33610 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Prim2P33610 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Prim2P33610 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Prim2P33610 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Prim2P33610 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Prim2P33610 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Prim2P33610 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Prim2P33610 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Prim2P33610 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Prim2P33610 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Prim2P33610 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Prim2P33610 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Prim2P33610 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Prim2P33610 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Prim2P33610 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Prim2P33610 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Prim2P33610 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Prim2P33610 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Prim2P33610 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Prim2P33610 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Prim2P33610 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Prim2P33610 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Prim2P33610 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Prim2P33610 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Prim2P33610 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Prim2P33610 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Prim2P33610 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Prim2P33610 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Prim2P33610 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Prim2P33610 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Prim2P33610 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Prim2P33610 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Prim2P33610 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Prim2P33610 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Prim2P33610 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Prim2P33610 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Prim2P33610 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Prim2P33610 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Prim2P33610 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Prim2P33610 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Prim2P33610 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Prim2P33610 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Prim2P33610 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Prim2P33610 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Prim2P33610 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Prim2P33610 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Prim2P33610 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Prim2P33610 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Prim2P33610 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68.1 ms