Protein–RNA interactions for Protein: P32020

Scp2, Non-specific lipid-transfer protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 547 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scp2P32020 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Scp2P32020 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
Scp2P32020 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Scp2P32020 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
Scp2P32020 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
Scp2P32020 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Scp2P32020 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Scp2P32020 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Scp2P32020 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Scp2P32020 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
Scp2P32020 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
Scp2P32020 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
Scp2P32020 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Scp2P32020 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Scp2P32020 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Scp2P32020 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Scp2P32020 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Scp2P32020 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
Scp2P32020 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Scp2P32020 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Scp2P32020 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Scp2P32020 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Scp2P32020 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Scp2P32020 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
Scp2P32020 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Scp2P32020 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
Scp2P32020 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
Scp2P32020 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.72
Scp2P32020 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Scp2P32020 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Scp2P32020 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
Scp2P32020 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Scp2P32020 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
Scp2P32020 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Scp2P32020 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Scp2P32020 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Scp2P32020 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Scp2P32020 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Scp2P32020 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Scp2P32020 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Scp2P32020 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Scp2P32020 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Scp2P32020 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Scp2P32020 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Scp2P32020 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Scp2P32020 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Scp2P32020 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Scp2P32020 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Scp2P32020 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Scp2P32020 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Scp2P32020 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Scp2P32020 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Scp2P32020 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Scp2P32020 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Scp2P32020 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Scp2P32020 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Scp2P32020 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Scp2P32020 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Scp2P32020 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Scp2P32020 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Scp2P32020 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Scp2P32020 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Scp2P32020 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Scp2P32020 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Scp2P32020 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
Scp2P32020 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Scp2P32020 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Scp2P32020 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Scp2P32020 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
Scp2P32020 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Scp2P32020 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Scp2P32020 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Scp2P32020 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Scp2P32020 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
Scp2P32020 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Scp2P32020 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Scp2P32020 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Scp2P32020 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
Scp2P32020 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Scp2P32020 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Scp2P32020 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Scp2P32020 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
Scp2P32020 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Scp2P32020 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Scp2P32020 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Scp2P32020 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Scp2P32020 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Scp2P32020 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Scp2P32020 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
Scp2P32020 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Scp2P32020 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Scp2P32020 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Scp2P32020 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
Scp2P32020 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Scp2P32020 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Scp2P32020 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Scp2P32020 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
Scp2P32020 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Scp2P32020 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Scp2P32020 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.3 ms