Protein–RNA interactions for Protein: P31313

Hoxc11, Homeobox protein Hox-C11, mousemouse

Predictions only

Length 304 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxc11P31313 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Hoxc11P31313 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Hoxc11P31313 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Hoxc11P31313 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Hoxc11P31313 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Hoxc11P31313 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Hoxc11P31313 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Hoxc11P31313 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Hoxc11P31313 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Hoxc11P31313 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Hoxc11P31313 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Hoxc11P31313 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Hoxc11P31313 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Hoxc11P31313 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Hoxc11P31313 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Hoxc11P31313 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Hoxc11P31313 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Hoxc11P31313 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Hoxc11P31313 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Hoxc11P31313 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Hoxc11P31313 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Hoxc11P31313 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Hoxc11P31313 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Hoxc11P31313 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Hoxc11P31313 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Hoxc11P31313 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Hoxc11P31313 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Hoxc11P31313 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Hoxc11P31313 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Hoxc11P31313 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Hoxc11P31313 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Hoxc11P31313 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Hoxc11P31313 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Hoxc11P31313 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Hoxc11P31313 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Hoxc11P31313 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Hoxc11P31313 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Hoxc11P31313 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Hoxc11P31313 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Hoxc11P31313 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Hoxc11P31313 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Hoxc11P31313 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Hoxc11P31313 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Hoxc11P31313 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Hoxc11P31313 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Hoxc11P31313 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Hoxc11P31313 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Hoxc11P31313 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Hoxc11P31313 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Hoxc11P31313 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Hoxc11P31313 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Hoxc11P31313 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Hoxc11P31313 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Hoxc11P31313 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Hoxc11P31313 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Hoxc11P31313 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Hoxc11P31313 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Hoxc11P31313 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
Hoxc11P31313 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Hoxc11P31313 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Hoxc11P31313 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Hoxc11P31313 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Hoxc11P31313 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
Hoxc11P31313 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Hoxc11P31313 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Hoxc11P31313 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Hoxc11P31313 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Hoxc11P31313 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Hoxc11P31313 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Hoxc11P31313 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Hoxc11P31313 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Hoxc11P31313 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
Hoxc11P31313 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Hoxc11P31313 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Hoxc11P31313 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Hoxc11P31313 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Hoxc11P31313 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
Hoxc11P31313 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
Hoxc11P31313 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Hoxc11P31313 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Hoxc11P31313 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Hoxc11P31313 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Hoxc11P31313 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Hoxc11P31313 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Hoxc11P31313 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Hoxc11P31313 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Hoxc11P31313 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Hoxc11P31313 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Hoxc11P31313 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Hoxc11P31313 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
Hoxc11P31313 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Hoxc11P31313 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Hoxc11P31313 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Hoxc11P31313 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Hoxc11P31313 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Hoxc11P31313 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Hoxc11P31313 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Hoxc11P31313 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Hoxc11P31313 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Hoxc11P31313 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.4 ms