Protein–RNA interactions for Protein: P31245

Hoxa2, Homeobox protein Hox-A2, mousemouse

Predictions only

Length 372 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxa2P31245 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Hoxa2P31245 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Hoxa2P31245 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Hoxa2P31245 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
Hoxa2P31245 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Hoxa2P31245 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Hoxa2P31245 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
Hoxa2P31245 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
Hoxa2P31245 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Hoxa2P31245 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Hoxa2P31245 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Hoxa2P31245 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Hoxa2P31245 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Hoxa2P31245 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Hoxa2P31245 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Hoxa2P31245 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
Hoxa2P31245 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Hoxa2P31245 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Hoxa2P31245 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Hoxa2P31245 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
Hoxa2P31245 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
Hoxa2P31245 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Hoxa2P31245 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Hoxa2P31245 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Hoxa2P31245 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Hoxa2P31245 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Hoxa2P31245 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Hoxa2P31245 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Hoxa2P31245 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Hoxa2P31245 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Hoxa2P31245 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Hoxa2P31245 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Hoxa2P31245 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Hoxa2P31245 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
Hoxa2P31245 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Hoxa2P31245 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Hoxa2P31245 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Hoxa2P31245 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Hoxa2P31245 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Hoxa2P31245 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Hoxa2P31245 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Hoxa2P31245 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Hoxa2P31245 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Hoxa2P31245 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Hoxa2P31245 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Hoxa2P31245 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Hoxa2P31245 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Hoxa2P31245 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Hoxa2P31245 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Hoxa2P31245 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Hoxa2P31245 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Hoxa2P31245 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Hoxa2P31245 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Hoxa2P31245 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Hoxa2P31245 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Hoxa2P31245 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Hoxa2P31245 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Hoxa2P31245 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Hoxa2P31245 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Hoxa2P31245 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Hoxa2P31245 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Hoxa2P31245 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Hoxa2P31245 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Hoxa2P31245 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Hoxa2P31245 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Hoxa2P31245 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Hoxa2P31245 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Hoxa2P31245 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Hoxa2P31245 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Hoxa2P31245 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Hoxa2P31245 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
Hoxa2P31245 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Hoxa2P31245 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Hoxa2P31245 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Hoxa2P31245 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Hoxa2P31245 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Hoxa2P31245 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Hoxa2P31245 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Hoxa2P31245 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Hoxa2P31245 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Hoxa2P31245 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Hoxa2P31245 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Hoxa2P31245 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Hoxa2P31245 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Hoxa2P31245 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Hoxa2P31245 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Hoxa2P31245 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Hoxa2P31245 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Hoxa2P31245 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Hoxa2P31245 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Hoxa2P31245 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Hoxa2P31245 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Hoxa2P31245 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Hoxa2P31245 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Hoxa2P31245 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Hoxa2P31245 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Hoxa2P31245 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Hoxa2P31245 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Hoxa2P31245 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Hoxa2P31245 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.5 ms