Protein–RNA interactions for Protein: P29595

Nedd8, NEDD8, mousemouse

Predictions only

Length 81 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nedd8P29595 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Nedd8P29595 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Nedd8P29595 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
Nedd8P29595 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Nedd8P29595 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Nedd8P29595 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Nedd8P29595 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Nedd8P29595 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Nedd8P29595 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Nedd8P29595 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Nedd8P29595 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Nedd8P29595 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Nedd8P29595 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Nedd8P29595 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Nedd8P29595 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Nedd8P29595 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
Nedd8P29595 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Nedd8P29595 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Nedd8P29595 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Nedd8P29595 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Nedd8P29595 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Nedd8P29595 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Nedd8P29595 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Nedd8P29595 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Nedd8P29595 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Nedd8P29595 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
Nedd8P29595 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Nedd8P29595 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Nedd8P29595 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Nedd8P29595 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Nedd8P29595 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Nedd8P29595 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
Nedd8P29595 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Nedd8P29595 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Nedd8P29595 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Nedd8P29595 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Nedd8P29595 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Nedd8P29595 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Nedd8P29595 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Nedd8P29595 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Nedd8P29595 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Nedd8P29595 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
Nedd8P29595 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Nedd8P29595 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Nedd8P29595 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Nedd8P29595 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Nedd8P29595 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Nedd8P29595 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Nedd8P29595 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Nedd8P29595 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Nedd8P29595 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Nedd8P29595 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Nedd8P29595 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Nedd8P29595 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Nedd8P29595 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Nedd8P29595 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Nedd8P29595 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Nedd8P29595 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Nedd8P29595 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Nedd8P29595 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Nedd8P29595 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Nedd8P29595 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Nedd8P29595 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Nedd8P29595 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Nedd8P29595 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Nedd8P29595 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Nedd8P29595 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Nedd8P29595 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Nedd8P29595 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Nedd8P29595 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Nedd8P29595 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Nedd8P29595 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
Nedd8P29595 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Nedd8P29595 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Nedd8P29595 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Nedd8P29595 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Nedd8P29595 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Nedd8P29595 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Nedd8P29595 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Nedd8P29595 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Nedd8P29595 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Nedd8P29595 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Nedd8P29595 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Nedd8P29595 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Nedd8P29595 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Nedd8P29595 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Nedd8P29595 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Nedd8P29595 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Nedd8P29595 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Nedd8P29595 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Nedd8P29595 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Nedd8P29595 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Nedd8P29595 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Nedd8P29595 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Nedd8P29595 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Nedd8P29595 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Nedd8P29595 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Nedd8P29595 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Nedd8P29595 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Nedd8P29595 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.2 ms