Protein–RNA interactions for Protein: P29341

Pabpc1, Polyadenylate-binding protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 636 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pabpc1P29341 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Pabpc1P29341 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Pabpc1P29341 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Pabpc1P29341 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Pabpc1P29341 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Pabpc1P29341 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Pabpc1P29341 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Pabpc1P29341 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Pabpc1P29341 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Pabpc1P29341 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Pabpc1P29341 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
Pabpc1P29341 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Pabpc1P29341 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Pabpc1P29341 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Pabpc1P29341 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Pabpc1P29341 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Pabpc1P29341 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Pabpc1P29341 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Pabpc1P29341 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Pabpc1P29341 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Pabpc1P29341 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Pabpc1P29341 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Pabpc1P29341 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Pabpc1P29341 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Pabpc1P29341 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Pabpc1P29341 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Pabpc1P29341 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Pabpc1P29341 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Pabpc1P29341 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Pabpc1P29341 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Pabpc1P29341 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Pabpc1P29341 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
Pabpc1P29341 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Pabpc1P29341 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Pabpc1P29341 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Pabpc1P29341 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Pabpc1P29341 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Pabpc1P29341 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC23.89■■□□□ 1.42
Pabpc1P29341 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Pabpc1P29341 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Pabpc1P29341 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Pabpc1P29341 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Pabpc1P29341 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Pabpc1P29341 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Pabpc1P29341 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Pabpc1P29341 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Pabpc1P29341 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Pabpc1P29341 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Pabpc1P29341 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
Pabpc1P29341 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Pabpc1P29341 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Pabpc1P29341 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Pabpc1P29341 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Pabpc1P29341 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Pabpc1P29341 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Pabpc1P29341 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Pabpc1P29341 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Pabpc1P29341 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Pabpc1P29341 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Pabpc1P29341 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Pabpc1P29341 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Pabpc1P29341 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Pabpc1P29341 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Pabpc1P29341 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
Pabpc1P29341 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Pabpc1P29341 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Pabpc1P29341 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Pabpc1P29341 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Pabpc1P29341 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Pabpc1P29341 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Pabpc1P29341 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Pabpc1P29341 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Pabpc1P29341 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Pabpc1P29341 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Pabpc1P29341 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Pabpc1P29341 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Pabpc1P29341 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Pabpc1P29341 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Pabpc1P29341 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
Pabpc1P29341 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Pabpc1P29341 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Pabpc1P29341 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Pabpc1P29341 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Pabpc1P29341 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Pabpc1P29341 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Pabpc1P29341 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Pabpc1P29341 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Pabpc1P29341 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
Pabpc1P29341 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Pabpc1P29341 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Pabpc1P29341 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Pabpc1P29341 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Pabpc1P29341 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Pabpc1P29341 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
Pabpc1P29341 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Pabpc1P29341 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Pabpc1P29341 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Pabpc1P29341 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Pabpc1P29341 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Pabpc1P29341 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 119 ms