Protein–RNA interactions for Protein: P28481

Col2a1, Collagen alpha-1(II) chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,487 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col2a1P28481 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
Col2a1P28481 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
Col2a1P28481 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC27.64■■■□□ 2.01
Col2a1P28481 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.01
Col2a1P28481 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Col2a1P28481 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Col2a1P28481 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
Col2a1P28481 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Col2a1P28481 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Col2a1P28481 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
Col2a1P28481 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
Col2a1P28481 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
Col2a1P28481 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
Col2a1P28481 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Col2a1P28481 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Col2a1P28481 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
Col2a1P28481 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Col2a1P28481 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Col2a1P28481 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
Col2a1P28481 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Col2a1P28481 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Col2a1P28481 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Col2a1P28481 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC27.57■■■□□ 2
Col2a1P28481 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Col2a1P28481 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Col2a1P28481 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Col2a1P28481 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
Col2a1P28481 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Col2a1P28481 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Col2a1P28481 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Col2a1P28481 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Col2a1P28481 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC27.53■■■□□ 2
Col2a1P28481 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■■□□ 2
Col2a1P28481 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Col2a1P28481 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
Col2a1P28481 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Col2a1P28481 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
Col2a1P28481 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
Col2a1P28481 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Col2a1P28481 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
Col2a1P28481 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Col2a1P28481 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Col2a1P28481 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Col2a1P28481 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
Col2a1P28481 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
Col2a1P28481 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
Col2a1P28481 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
Col2a1P28481 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
Col2a1P28481 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
Col2a1P28481 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Col2a1P28481 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Col2a1P28481 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Col2a1P28481 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Col2a1P28481 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Col2a1P28481 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Col2a1P28481 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Col2a1P28481 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Col2a1P28481 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Col2a1P28481 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
Col2a1P28481 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Col2a1P28481 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Col2a1P28481 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Col2a1P28481 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
Col2a1P28481 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Col2a1P28481 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Col2a1P28481 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Col2a1P28481 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
Col2a1P28481 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Col2a1P28481 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
Col2a1P28481 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Col2a1P28481 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
Col2a1P28481 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Col2a1P28481 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Col2a1P28481 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC27.34■■□□□ 1.97
Col2a1P28481 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC27.34■■□□□ 1.97
Col2a1P28481 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Col2a1P28481 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Col2a1P28481 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Col2a1P28481 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Col2a1P28481 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
Col2a1P28481 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Col2a1P28481 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Col2a1P28481 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
Col2a1P28481 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Col2a1P28481 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Col2a1P28481 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC27.3■■□□□ 1.96
Col2a1P28481 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Col2a1P28481 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC27.28■■□□□ 1.96
Col2a1P28481 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
Col2a1P28481 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Col2a1P28481 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
Col2a1P28481 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
Col2a1P28481 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Col2a1P28481 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Col2a1P28481 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.96
Col2a1P28481 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Col2a1P28481 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Col2a1P28481 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
Col2a1P28481 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC27.25■■□□□ 1.95
Col2a1P28481 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.1 ms