Protein–RNA interactions for Protein: P28312

Defa5, Alpha-defensin 5, mousemouse

Predictions only

Length 93 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Defa5P28312 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Defa5P28312 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Defa5P28312 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Defa5P28312 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Defa5P28312 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Defa5P28312 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Defa5P28312 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Defa5P28312 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Defa5P28312 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Defa5P28312 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Defa5P28312 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Defa5P28312 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Defa5P28312 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Defa5P28312 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Defa5P28312 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Defa5P28312 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Defa5P28312 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Defa5P28312 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Defa5P28312 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Defa5P28312 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Defa5P28312 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Defa5P28312 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Defa5P28312 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Defa5P28312 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Defa5P28312 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Defa5P28312 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Defa5P28312 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Defa5P28312 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Defa5P28312 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Defa5P28312 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Defa5P28312 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Defa5P28312 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Defa5P28312 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Defa5P28312 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Defa5P28312 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
Defa5P28312 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Defa5P28312 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Defa5P28312 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Defa5P28312 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
Defa5P28312 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Defa5P28312 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Defa5P28312 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Defa5P28312 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Defa5P28312 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Defa5P28312 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Defa5P28312 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Defa5P28312 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Defa5P28312 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Defa5P28312 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Defa5P28312 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Defa5P28312 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Defa5P28312 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Defa5P28312 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Defa5P28312 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Defa5P28312 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Defa5P28312 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Defa5P28312 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Defa5P28312 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Defa5P28312 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Defa5P28312 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
Defa5P28312 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Defa5P28312 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Defa5P28312 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Defa5P28312 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Defa5P28312 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Defa5P28312 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Defa5P28312 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Defa5P28312 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Defa5P28312 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Defa5P28312 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Defa5P28312 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Defa5P28312 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Defa5P28312 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Defa5P28312 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Defa5P28312 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Defa5P28312 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Defa5P28312 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Defa5P28312 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Defa5P28312 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Defa5P28312 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Defa5P28312 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Defa5P28312 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Defa5P28312 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Defa5P28312 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Defa5P28312 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Defa5P28312 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Defa5P28312 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Defa5P28312 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Defa5P28312 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Defa5P28312 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Defa5P28312 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Defa5P28312 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Defa5P28312 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Defa5P28312 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Defa5P28312 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Defa5P28312 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Defa5P28312 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Defa5P28312 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Defa5P28312 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Defa5P28312 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.5 ms