Protein–RNA interactions for Protein: P28033

Cebpb, CCAAT/enhancer-binding protein beta, mousemouse

Predictions only

Length 296 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CebpbP28033 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CebpbP28033 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CebpbP28033 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
CebpbP28033 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CebpbP28033 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CebpbP28033 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CebpbP28033 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CebpbP28033 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CebpbP28033 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CebpbP28033 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CebpbP28033 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CebpbP28033 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CebpbP28033 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CebpbP28033 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CebpbP28033 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CebpbP28033 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CebpbP28033 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CebpbP28033 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CebpbP28033 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CebpbP28033 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CebpbP28033 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
CebpbP28033 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
CebpbP28033 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CebpbP28033 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CebpbP28033 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
CebpbP28033 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CebpbP28033 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CebpbP28033 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CebpbP28033 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
CebpbP28033 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
CebpbP28033 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CebpbP28033 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CebpbP28033 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
CebpbP28033 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CebpbP28033 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CebpbP28033 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CebpbP28033 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CebpbP28033 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CebpbP28033 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CebpbP28033 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CebpbP28033 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CebpbP28033 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CebpbP28033 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CebpbP28033 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CebpbP28033 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CebpbP28033 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CebpbP28033 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
CebpbP28033 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CebpbP28033 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CebpbP28033 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CebpbP28033 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CebpbP28033 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CebpbP28033 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CebpbP28033 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CebpbP28033 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
CebpbP28033 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CebpbP28033 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CebpbP28033 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CebpbP28033 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CebpbP28033 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CebpbP28033 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
CebpbP28033 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CebpbP28033 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CebpbP28033 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CebpbP28033 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CebpbP28033 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CebpbP28033 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CebpbP28033 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CebpbP28033 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
CebpbP28033 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CebpbP28033 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
CebpbP28033 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CebpbP28033 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CebpbP28033 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CebpbP28033 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CebpbP28033 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CebpbP28033 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
CebpbP28033 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CebpbP28033 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CebpbP28033 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CebpbP28033 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
CebpbP28033 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CebpbP28033 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CebpbP28033 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CebpbP28033 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CebpbP28033 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CebpbP28033 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CebpbP28033 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
CebpbP28033 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CebpbP28033 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CebpbP28033 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CebpbP28033 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
CebpbP28033 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CebpbP28033 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CebpbP28033 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CebpbP28033 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CebpbP28033 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
CebpbP28033 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CebpbP28033 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CebpbP28033 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 147.5 ms