Protein–RNA interactions for Protein: P27641

Xrcc5, X-ray repair cross-complementing protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 732 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Xrcc5P27641 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Xrcc5P27641 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Xrcc5P27641 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Xrcc5P27641 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Xrcc5P27641 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Xrcc5P27641 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Xrcc5P27641 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Xrcc5P27641 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Xrcc5P27641 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Xrcc5P27641 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Xrcc5P27641 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Xrcc5P27641 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
Xrcc5P27641 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Xrcc5P27641 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Xrcc5P27641 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Xrcc5P27641 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Xrcc5P27641 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Xrcc5P27641 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Xrcc5P27641 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Xrcc5P27641 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Xrcc5P27641 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Xrcc5P27641 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Xrcc5P27641 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Xrcc5P27641 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Xrcc5P27641 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Xrcc5P27641 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Xrcc5P27641 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
Xrcc5P27641 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Xrcc5P27641 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Xrcc5P27641 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Xrcc5P27641 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Xrcc5P27641 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Xrcc5P27641 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Xrcc5P27641 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Xrcc5P27641 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Xrcc5P27641 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Xrcc5P27641 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Xrcc5P27641 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Xrcc5P27641 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Xrcc5P27641 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Xrcc5P27641 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Xrcc5P27641 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Xrcc5P27641 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Xrcc5P27641 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Xrcc5P27641 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Xrcc5P27641 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Xrcc5P27641 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Xrcc5P27641 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Xrcc5P27641 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Xrcc5P27641 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Xrcc5P27641 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Xrcc5P27641 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
Xrcc5P27641 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Xrcc5P27641 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Xrcc5P27641 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Xrcc5P27641 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Xrcc5P27641 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Xrcc5P27641 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Xrcc5P27641 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Xrcc5P27641 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Xrcc5P27641 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Xrcc5P27641 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Xrcc5P27641 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC24.89■■□□□ 1.57
Xrcc5P27641 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC24.89■■□□□ 1.57
Xrcc5P27641 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Xrcc5P27641 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Xrcc5P27641 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Xrcc5P27641 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Xrcc5P27641 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Xrcc5P27641 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Xrcc5P27641 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Xrcc5P27641 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Xrcc5P27641 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Xrcc5P27641 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
Xrcc5P27641 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Xrcc5P27641 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Xrcc5P27641 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Xrcc5P27641 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Xrcc5P27641 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Xrcc5P27641 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
Xrcc5P27641 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Xrcc5P27641 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Xrcc5P27641 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Xrcc5P27641 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Xrcc5P27641 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Xrcc5P27641 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Xrcc5P27641 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Xrcc5P27641 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
Xrcc5P27641 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
Xrcc5P27641 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Xrcc5P27641 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Xrcc5P27641 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Xrcc5P27641 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Xrcc5P27641 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Xrcc5P27641 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Xrcc5P27641 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Xrcc5P27641 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Xrcc5P27641 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Xrcc5P27641 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Xrcc5P27641 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.6 ms