Protein–RNA interactions for Protein: P26369

U2af2, Splicing factor U2AF 65 kDa subunit, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 475 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
U2af2P26369 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
U2af2P26369 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
U2af2P26369 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
U2af2P26369 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
U2af2P26369 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
U2af2P26369 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
U2af2P26369 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC27.15■■□□□ 1.94
U2af2P26369 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
U2af2P26369 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
U2af2P26369 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
U2af2P26369 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
U2af2P26369 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
U2af2P26369 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
U2af2P26369 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
U2af2P26369 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
U2af2P26369 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
U2af2P26369 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
U2af2P26369 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
U2af2P26369 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
U2af2P26369 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
U2af2P26369 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
U2af2P26369 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
U2af2P26369 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
U2af2P26369 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
U2af2P26369 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
U2af2P26369 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
U2af2P26369 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
U2af2P26369 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
U2af2P26369 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
U2af2P26369 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
U2af2P26369 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
U2af2P26369 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
U2af2P26369 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
U2af2P26369 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.06■■□□□ 1.92
U2af2P26369 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
U2af2P26369 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
U2af2P26369 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
U2af2P26369 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
U2af2P26369 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
U2af2P26369 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
U2af2P26369 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
U2af2P26369 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
U2af2P26369 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
U2af2P26369 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
U2af2P26369 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
U2af2P26369 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
U2af2P26369 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
U2af2P26369 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
U2af2P26369 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
U2af2P26369 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC26.99■■□□□ 1.91
U2af2P26369 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
U2af2P26369 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
U2af2P26369 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
U2af2P26369 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC26.97■■□□□ 1.91
U2af2P26369 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
U2af2P26369 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
U2af2P26369 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
U2af2P26369 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
U2af2P26369 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC26.95■■□□□ 1.91
U2af2P26369 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC26.94■■□□□ 1.9
U2af2P26369 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
U2af2P26369 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
U2af2P26369 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
U2af2P26369 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
U2af2P26369 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
U2af2P26369 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
U2af2P26369 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
U2af2P26369 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
U2af2P26369 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
U2af2P26369 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
U2af2P26369 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
U2af2P26369 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
U2af2P26369 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
U2af2P26369 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
U2af2P26369 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC26.88■■□□□ 1.89
U2af2P26369 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC26.88■■□□□ 1.89
U2af2P26369 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
U2af2P26369 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
U2af2P26369 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
U2af2P26369 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
U2af2P26369 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
U2af2P26369 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
U2af2P26369 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
U2af2P26369 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
U2af2P26369 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
U2af2P26369 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
U2af2P26369 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
U2af2P26369 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
U2af2P26369 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
U2af2P26369 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
U2af2P26369 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
U2af2P26369 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
U2af2P26369 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
U2af2P26369 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
U2af2P26369 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
U2af2P26369 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
U2af2P26369 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
U2af2P26369 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
U2af2P26369 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
U2af2P26369 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38 ms