Protein–RNA interactions for Protein: P23336

Ggta1, N-acetyllactosaminide alpha-1,3-galactosyltransferase, mousemouse

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Length 394 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ggta1P23336 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ggta1P23336 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Ggta1P23336 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Ggta1P23336 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Ggta1P23336 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Ggta1P23336 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
Ggta1P23336 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Ggta1P23336 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Ggta1P23336 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ggta1P23336 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ggta1P23336 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ggta1P23336 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ggta1P23336 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ggta1P23336 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ggta1P23336 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ggta1P23336 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ggta1P23336 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ggta1P23336 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ggta1P23336 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
Ggta1P23336 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ggta1P23336 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ggta1P23336 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ggta1P23336 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.11
Ggta1P23336 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ggta1P23336 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ggta1P23336 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ggta1P23336 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ggta1P23336 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ggta1P23336 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ggta1P23336 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ggta1P23336 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ggta1P23336 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ggta1P23336 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ggta1P23336 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ggta1P23336 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
Ggta1P23336 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ggta1P23336 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ggta1P23336 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
Ggta1P23336 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ggta1P23336 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ggta1P23336 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ggta1P23336 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Ggta1P23336 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ggta1P23336 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ggta1P23336 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ggta1P23336 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ggta1P23336 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ggta1P23336 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ggta1P23336 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ggta1P23336 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ggta1P23336 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ggta1P23336 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ggta1P23336 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ggta1P23336 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ggta1P23336 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ggta1P23336 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ggta1P23336 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ggta1P23336 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Ggta1P23336 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Ggta1P23336 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Ggta1P23336 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ggta1P23336 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ggta1P23336 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ggta1P23336 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ggta1P23336 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ggta1P23336 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ggta1P23336 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
Ggta1P23336 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ggta1P23336 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ggta1P23336 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ggta1P23336 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ggta1P23336 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ggta1P23336 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ggta1P23336 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ggta1P23336 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Ggta1P23336 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Ggta1P23336 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ggta1P23336 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ggta1P23336 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ggta1P23336 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ggta1P23336 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ggta1P23336 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ggta1P23336 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ggta1P23336 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ggta1P23336 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ggta1P23336 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ggta1P23336 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ggta1P23336 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ggta1P23336 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ggta1P23336 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ggta1P23336 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ggta1P23336 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ggta1P23336 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ggta1P23336 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ggta1P23336 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ggta1P23336 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ggta1P23336 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ggta1P23336 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ggta1P23336 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ggta1P23336 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.1 ms