Protein–RNA interactions for Protein: P22339

Gadd45b, Growth arrest and DNA damage-inducible protein GADD45 beta, mousemouse

Predictions only

Length 160 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gadd45bP22339 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,19■■□□□ 1,94
Gadd45bP22339 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC27,19■■□□□ 1,94
Gadd45bP22339 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC27,18■■□□□ 1,94
Gadd45bP22339 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC27,18■■□□□ 1,94
Gadd45bP22339 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC27,17■■□□□ 1,94
Gadd45bP22339 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC27,17■■□□□ 1,94
Gadd45bP22339 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC27,17■■□□□ 1,94
Gadd45bP22339 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,17■■□□□ 1,94
Gadd45bP22339 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27,16■■□□□ 1,94
Gadd45bP22339 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC27,16■■□□□ 1,94
Gadd45bP22339 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC27,16■■□□□ 1,94
Gadd45bP22339 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,16■■□□□ 1,94
Gadd45bP22339 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,15■■□□□ 1,94
Gadd45bP22339 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC27,14■■□□□ 1,94
Gadd45bP22339 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,13■■□□□ 1,93
Gadd45bP22339 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27,13■■□□□ 1,93
Gadd45bP22339 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,13■■□□□ 1,93
Gadd45bP22339 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,13■■□□□ 1,93
Gadd45bP22339 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27,12■■□□□ 1,93
Gadd45bP22339 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC27,12■■□□□ 1,93
Gadd45bP22339 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC27,12■■□□□ 1,93
Gadd45bP22339 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC27,12■■□□□ 1,93
Gadd45bP22339 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,11■■□□□ 1,93
Gadd45bP22339 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC27,11■■□□□ 1,93
Gadd45bP22339 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,11■■□□□ 1,93
Gadd45bP22339 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC27,1■■□□□ 1,93
Gadd45bP22339 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,1■■□□□ 1,93
Gadd45bP22339 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,09■■□□□ 1,93
Gadd45bP22339 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27,09■■□□□ 1,93
Gadd45bP22339 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,09■■□□□ 1,93
Gadd45bP22339 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27,09■■□□□ 1,93
Gadd45bP22339 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC27,09■■□□□ 1,93
Gadd45bP22339 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC27,09■■□□□ 1,93
Gadd45bP22339 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27,09■■□□□ 1,93
Gadd45bP22339 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,08■■□□□ 1,93
Gadd45bP22339 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC27,08■■□□□ 1,93
Gadd45bP22339 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27,08■■□□□ 1,93
Gadd45bP22339 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC27,08■■□□□ 1,93
Gadd45bP22339 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27,08■■□□□ 1,93
Gadd45bP22339 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC27,06■■□□□ 1,92
Gadd45bP22339 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC27,06■■□□□ 1,92
Gadd45bP22339 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27,05■■□□□ 1,92
Gadd45bP22339 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,05■■□□□ 1,92
Gadd45bP22339 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27,05■■□□□ 1,92
Gadd45bP22339 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27,05■■□□□ 1,92
Gadd45bP22339 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27,05■■□□□ 1,92
Gadd45bP22339 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC27,04■■□□□ 1,92
Gadd45bP22339 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC27,03■■□□□ 1,92
Gadd45bP22339 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,03■■□□□ 1,92
Gadd45bP22339 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,03■■□□□ 1,92
Gadd45bP22339 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC27,02■■□□□ 1,92
Gadd45bP22339 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,02■■□□□ 1,92
Gadd45bP22339 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,02■■□□□ 1,92
Gadd45bP22339 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC27,02■■□□□ 1,92
Gadd45bP22339 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,02■■□□□ 1,92
Gadd45bP22339 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27,02■■□□□ 1,92
Gadd45bP22339 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27,01■■□□□ 1,92
Gadd45bP22339 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC27,01■■□□□ 1,91
Gadd45bP22339 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27,01■■□□□ 1,91
Gadd45bP22339 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC27■■□□□ 1,91
Gadd45bP22339 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,99■■□□□ 1,91
Gadd45bP22339 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26,98■■□□□ 1,91
Gadd45bP22339 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,98■■□□□ 1,91
Gadd45bP22339 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,98■■□□□ 1,91
Gadd45bP22339 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,98■■□□□ 1,91
Gadd45bP22339 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,97■■□□□ 1,91
Gadd45bP22339 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26,97■■□□□ 1,91
Gadd45bP22339 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26,96■■□□□ 1,91
Gadd45bP22339 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,96■■□□□ 1,91
Gadd45bP22339 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC26,96■■□□□ 1,91
Gadd45bP22339 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC26,96■■□□□ 1,91
Gadd45bP22339 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC26,95■■□□□ 1,9
Gadd45bP22339 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,95■■□□□ 1,9
Gadd45bP22339 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,95■■□□□ 1,9
Gadd45bP22339 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,94■■□□□ 1,9
Gadd45bP22339 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26,94■■□□□ 1,9
Gadd45bP22339 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,92■■□□□ 1,9
Gadd45bP22339 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26,92■■□□□ 1,9
Gadd45bP22339 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,92■■□□□ 1,9
Gadd45bP22339 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26,92■■□□□ 1,9
Gadd45bP22339 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,92■■□□□ 1,9
Gadd45bP22339 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC26,91■■□□□ 1,9
Gadd45bP22339 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC26,91■■□□□ 1,9
Gadd45bP22339 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC26,91■■□□□ 1,9
Gadd45bP22339 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26,9■■□□□ 1,9
Gadd45bP22339 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,9■■□□□ 1,9
Gadd45bP22339 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26,89■■□□□ 1,9
Gadd45bP22339 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC26,89■■□□□ 1,9
Gadd45bP22339 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26,89■■□□□ 1,89
Gadd45bP22339 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,89■■□□□ 1,89
Gadd45bP22339 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC26,89■■□□□ 1,89
Gadd45bP22339 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC26,88■■□□□ 1,89
Gadd45bP22339 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,88■■□□□ 1,89
Gadd45bP22339 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,88■■□□□ 1,89
Gadd45bP22339 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC26,88■■□□□ 1,89
Gadd45bP22339 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,87■■□□□ 1,89
Gadd45bP22339 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,87■■□□□ 1,89
Gadd45bP22339 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,87■■□□□ 1,89
Gadd45bP22339 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26,86■■□□□ 1,89
Gadd45bP22339 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26,86■■□□□ 1,89
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32,7 ms