Protein–RNA interactions for Protein: P22227

Zfp42, Zinc finger protein 42, mousemouse

Predictions only

Length 288 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zfp42P22227 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Zfp42P22227 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Zfp42P22227 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Zfp42P22227 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Zfp42P22227 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Zfp42P22227 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Zfp42P22227 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Zfp42P22227 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Zfp42P22227 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Zfp42P22227 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
Zfp42P22227 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Zfp42P22227 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Zfp42P22227 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Zfp42P22227 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Zfp42P22227 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Zfp42P22227 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Zfp42P22227 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Zfp42P22227 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Zfp42P22227 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Zfp42P22227 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Zfp42P22227 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Zfp42P22227 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Zfp42P22227 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Zfp42P22227 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Zfp42P22227 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Zfp42P22227 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Zfp42P22227 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Zfp42P22227 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Zfp42P22227 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Zfp42P22227 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Zfp42P22227 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Zfp42P22227 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Zfp42P22227 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Zfp42P22227 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Zfp42P22227 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Zfp42P22227 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Zfp42P22227 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Zfp42P22227 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Zfp42P22227 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Zfp42P22227 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Zfp42P22227 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Zfp42P22227 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Zfp42P22227 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Zfp42P22227 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Zfp42P22227 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Zfp42P22227 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Zfp42P22227 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Zfp42P22227 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Zfp42P22227 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Zfp42P22227 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Zfp42P22227 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Zfp42P22227 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Zfp42P22227 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Zfp42P22227 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
Zfp42P22227 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Zfp42P22227 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Zfp42P22227 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Zfp42P22227 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Zfp42P22227 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Zfp42P22227 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Zfp42P22227 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Zfp42P22227 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Zfp42P22227 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Zfp42P22227 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Zfp42P22227 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Zfp42P22227 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Zfp42P22227 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Zfp42P22227 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Zfp42P22227 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Zfp42P22227 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Zfp42P22227 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Zfp42P22227 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Zfp42P22227 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Zfp42P22227 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Zfp42P22227 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Zfp42P22227 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Zfp42P22227 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Zfp42P22227 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Zfp42P22227 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Zfp42P22227 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Zfp42P22227 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Zfp42P22227 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
Zfp42P22227 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Zfp42P22227 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Zfp42P22227 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Zfp42P22227 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Zfp42P22227 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Zfp42P22227 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Zfp42P22227 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Zfp42P22227 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Zfp42P22227 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Zfp42P22227 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Zfp42P22227 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Zfp42P22227 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Zfp42P22227 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Zfp42P22227 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Zfp42P22227 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Zfp42P22227 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Zfp42P22227 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Zfp42P22227 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.2 ms