Protein–RNA interactions for Protein: P21661

Pcsk2, Neuroendocrine convertase 2, mousemouse

Predictions only

Length 637 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pcsk2P21661 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Pcsk2P21661 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Pcsk2P21661 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Pcsk2P21661 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Pcsk2P21661 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Pcsk2P21661 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Pcsk2P21661 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Pcsk2P21661 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Pcsk2P21661 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Pcsk2P21661 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Pcsk2P21661 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Pcsk2P21661 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Pcsk2P21661 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Pcsk2P21661 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Pcsk2P21661 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Pcsk2P21661 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Pcsk2P21661 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Pcsk2P21661 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Pcsk2P21661 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Pcsk2P21661 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Pcsk2P21661 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Pcsk2P21661 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Pcsk2P21661 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Pcsk2P21661 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Pcsk2P21661 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Pcsk2P21661 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Pcsk2P21661 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Pcsk2P21661 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Pcsk2P21661 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Pcsk2P21661 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Pcsk2P21661 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Pcsk2P21661 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Pcsk2P21661 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Pcsk2P21661 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Pcsk2P21661 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Pcsk2P21661 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Pcsk2P21661 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Pcsk2P21661 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Pcsk2P21661 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Pcsk2P21661 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Pcsk2P21661 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Pcsk2P21661 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Pcsk2P21661 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Pcsk2P21661 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Pcsk2P21661 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Pcsk2P21661 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Pcsk2P21661 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Pcsk2P21661 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Pcsk2P21661 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Pcsk2P21661 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Pcsk2P21661 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Pcsk2P21661 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Pcsk2P21661 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Pcsk2P21661 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Pcsk2P21661 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Pcsk2P21661 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Pcsk2P21661 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Pcsk2P21661 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Pcsk2P21661 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Pcsk2P21661 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Pcsk2P21661 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Pcsk2P21661 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Pcsk2P21661 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Pcsk2P21661 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Pcsk2P21661 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Pcsk2P21661 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Pcsk2P21661 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Pcsk2P21661 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Pcsk2P21661 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Pcsk2P21661 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Pcsk2P21661 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Pcsk2P21661 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Pcsk2P21661 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Pcsk2P21661 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Pcsk2P21661 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Pcsk2P21661 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Pcsk2P21661 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Pcsk2P21661 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Pcsk2P21661 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Pcsk2P21661 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Pcsk2P21661 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Pcsk2P21661 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Pcsk2P21661 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Pcsk2P21661 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Pcsk2P21661 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Pcsk2P21661 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Pcsk2P21661 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
Pcsk2P21661 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Pcsk2P21661 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Pcsk2P21661 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Pcsk2P21661 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Pcsk2P21661 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Pcsk2P21661 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Pcsk2P21661 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Pcsk2P21661 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Pcsk2P21661 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Pcsk2P21661 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
Pcsk2P21661 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Pcsk2P21661 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Pcsk2P21661 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.6 ms