Protein–RNA interactions for Protein: P20490

Ms4a2, High affinity immunoglobulin epsilon receptor subunit beta, mousemouse

Predictions only

Length 235 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ms4a2P20490 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Ms4a2P20490 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Ms4a2P20490 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Ms4a2P20490 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
Ms4a2P20490 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Ms4a2P20490 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Ms4a2P20490 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Ms4a2P20490 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Ms4a2P20490 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Ms4a2P20490 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC28.13■■■□□ 2.09
Ms4a2P20490 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Ms4a2P20490 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Ms4a2P20490 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Ms4a2P20490 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Ms4a2P20490 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Ms4a2P20490 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
Ms4a2P20490 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
Ms4a2P20490 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Ms4a2P20490 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Ms4a2P20490 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Ms4a2P20490 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Ms4a2P20490 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Ms4a2P20490 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Ms4a2P20490 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Ms4a2P20490 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Ms4a2P20490 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
Ms4a2P20490 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Ms4a2P20490 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Ms4a2P20490 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Ms4a2P20490 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.04■■■□□ 2.08
Ms4a2P20490 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Ms4a2P20490 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Ms4a2P20490 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Ms4a2P20490 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Ms4a2P20490 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
Ms4a2P20490 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
Ms4a2P20490 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Ms4a2P20490 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.08
Ms4a2P20490 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Ms4a2P20490 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC28■■■□□ 2.07
Ms4a2P20490 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Ms4a2P20490 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Ms4a2P20490 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Ms4a2P20490 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Ms4a2P20490 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Ms4a2P20490 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Ms4a2P20490 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC27.96■■■□□ 2.07
Ms4a2P20490 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC27.96■■■□□ 2.07
Ms4a2P20490 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
Ms4a2P20490 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
Ms4a2P20490 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
Ms4a2P20490 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
Ms4a2P20490 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Ms4a2P20490 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Ms4a2P20490 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Ms4a2P20490 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
Ms4a2P20490 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Ms4a2P20490 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC27.94■■■□□ 2.06
Ms4a2P20490 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Ms4a2P20490 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Ms4a2P20490 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Ms4a2P20490 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Ms4a2P20490 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Ms4a2P20490 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
Ms4a2P20490 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
Ms4a2P20490 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Ms4a2P20490 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC27.89■■■□□ 2.06
Ms4a2P20490 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Ms4a2P20490 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Ms4a2P20490 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Ms4a2P20490 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC27.89■■■□□ 2.05
Ms4a2P20490 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Ms4a2P20490 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Ms4a2P20490 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Ms4a2P20490 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC27.87■■■□□ 2.05
Ms4a2P20490 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
Ms4a2P20490 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
Ms4a2P20490 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Ms4a2P20490 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Ms4a2P20490 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Ms4a2P20490 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Ms4a2P20490 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Ms4a2P20490 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
Ms4a2P20490 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Ms4a2P20490 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Ms4a2P20490 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
Ms4a2P20490 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Ms4a2P20490 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
Ms4a2P20490 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Ms4a2P20490 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
Ms4a2P20490 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC27.82■■■□□ 2.04
Ms4a2P20490 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Ms4a2P20490 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Ms4a2P20490 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Ms4a2P20490 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
Ms4a2P20490 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC27.79■■■□□ 2.04
Ms4a2P20490 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC27.77■■■□□ 2.04
Ms4a2P20490 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC27.77■■■□□ 2.04
Ms4a2P20490 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Ms4a2P20490 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.5 ms