Protein–RNA interactions for Protein: P20444

Prkca, Protein kinase C alpha type, mousemouse

Predictions only

Length 672 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrkcaP20444 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
PrkcaP20444 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
PrkcaP20444 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
PrkcaP20444 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
PrkcaP20444 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
PrkcaP20444 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
PrkcaP20444 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
PrkcaP20444 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
PrkcaP20444 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PrkcaP20444 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PrkcaP20444 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PrkcaP20444 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PrkcaP20444 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC21.12■□□□□ 0.97
PrkcaP20444 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PrkcaP20444 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
PrkcaP20444 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PrkcaP20444 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
PrkcaP20444 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PrkcaP20444 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PrkcaP20444 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PrkcaP20444 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PrkcaP20444 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
PrkcaP20444 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
PrkcaP20444 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
PrkcaP20444 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
PrkcaP20444 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
PrkcaP20444 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
PrkcaP20444 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
PrkcaP20444 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
PrkcaP20444 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
PrkcaP20444 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
PrkcaP20444 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
PrkcaP20444 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
PrkcaP20444 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
PrkcaP20444 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
PrkcaP20444 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
PrkcaP20444 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
PrkcaP20444 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
PrkcaP20444 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
PrkcaP20444 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
PrkcaP20444 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
PrkcaP20444 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
PrkcaP20444 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.95
PrkcaP20444 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
PrkcaP20444 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
PrkcaP20444 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
PrkcaP20444 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
PrkcaP20444 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
PrkcaP20444 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
PrkcaP20444 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
PrkcaP20444 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
PrkcaP20444 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
PrkcaP20444 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
PrkcaP20444 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
PrkcaP20444 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
PrkcaP20444 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
PrkcaP20444 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
PrkcaP20444 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
PrkcaP20444 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
PrkcaP20444 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
PrkcaP20444 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
PrkcaP20444 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
PrkcaP20444 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
PrkcaP20444 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
PrkcaP20444 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
PrkcaP20444 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
PrkcaP20444 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
PrkcaP20444 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
PrkcaP20444 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
PrkcaP20444 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
PrkcaP20444 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
PrkcaP20444 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
PrkcaP20444 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
PrkcaP20444 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
PrkcaP20444 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
PrkcaP20444 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
PrkcaP20444 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
PrkcaP20444 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
PrkcaP20444 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
PrkcaP20444 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
PrkcaP20444 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
PrkcaP20444 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC20.92■□□□□ 0.94
PrkcaP20444 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
PrkcaP20444 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
PrkcaP20444 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
PrkcaP20444 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC20.92■□□□□ 0.94
PrkcaP20444 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
PrkcaP20444 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
PrkcaP20444 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
PrkcaP20444 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
PrkcaP20444 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
PrkcaP20444 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
PrkcaP20444 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
PrkcaP20444 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
PrkcaP20444 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
PrkcaP20444 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC20.88■□□□□ 0.93
PrkcaP20444 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
PrkcaP20444 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
PrkcaP20444 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
PrkcaP20444 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.4 ms