Protein–RNA interactions for Protein: P20293

T, Brachyury protein, mousemouse

Predictions only

Length 436 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TP20293 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TP20293 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
TP20293 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
TP20293 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
TP20293 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
TP20293 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TP20293 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TP20293 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TP20293 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TP20293 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
TP20293 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TP20293 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
TP20293 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
TP20293 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
TP20293 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TP20293 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TP20293 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
TP20293 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
TP20293 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
TP20293 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
TP20293 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
TP20293 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
TP20293 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
TP20293 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
TP20293 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
TP20293 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
TP20293 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
TP20293 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
TP20293 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
TP20293 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
TP20293 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
TP20293 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
TP20293 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
TP20293 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
TP20293 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
TP20293 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TP20293 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TP20293 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
TP20293 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TP20293 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC21.87■■□□□ 1.09
TP20293 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
TP20293 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
TP20293 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
TP20293 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
TP20293 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TP20293 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TP20293 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC21.85■■□□□ 1.09
TP20293 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TP20293 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
TP20293 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TP20293 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
TP20293 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
TP20293 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
TP20293 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
TP20293 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
TP20293 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
TP20293 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
TP20293 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
TP20293 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
TP20293 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
TP20293 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
TP20293 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
TP20293 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
TP20293 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
TP20293 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
TP20293 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
TP20293 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
TP20293 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
TP20293 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
TP20293 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
TP20293 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
TP20293 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
TP20293 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
TP20293 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
TP20293 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
TP20293 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
TP20293 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
TP20293 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
TP20293 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
TP20293 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
TP20293 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
TP20293 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
TP20293 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
TP20293 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
TP20293 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
TP20293 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
TP20293 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
TP20293 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
TP20293 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
TP20293 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
TP20293 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
TP20293 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
TP20293 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
TP20293 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
TP20293 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
TP20293 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
TP20293 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
TP20293 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
TP20293 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
TP20293 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.6 ms