Protein–RNA interactions for Protein: P19246

Nefh, Neurofilament heavy polypeptide, mousemouse

Predictions only

Length 1,090 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NefhP19246 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
NefhP19246 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
NefhP19246 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
NefhP19246 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
NefhP19246 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
NefhP19246 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
NefhP19246 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
NefhP19246 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
NefhP19246 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
NefhP19246 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
NefhP19246 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC27.61■■■□□ 2.01
NefhP19246 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
NefhP19246 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
NefhP19246 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
NefhP19246 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
NefhP19246 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
NefhP19246 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
NefhP19246 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC27.59■■■□□ 2.01
NefhP19246 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
NefhP19246 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
NefhP19246 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC27.57■■■□□ 2
NefhP19246 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
NefhP19246 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
NefhP19246 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
NefhP19246 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
NefhP19246 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
NefhP19246 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC27.56■■■□□ 2
NefhP19246 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
NefhP19246 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
NefhP19246 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
NefhP19246 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
NefhP19246 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
NefhP19246 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
NefhP19246 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
NefhP19246 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
NefhP19246 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
NefhP19246 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
NefhP19246 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC27.51■■□□□ 1.99
NefhP19246 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
NefhP19246 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
NefhP19246 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
NefhP19246 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
NefhP19246 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
NefhP19246 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
NefhP19246 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
NefhP19246 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
NefhP19246 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
NefhP19246 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
NefhP19246 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
NefhP19246 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
NefhP19246 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
NefhP19246 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
NefhP19246 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
NefhP19246 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
NefhP19246 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
NefhP19246 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
NefhP19246 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
NefhP19246 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
NefhP19246 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
NefhP19246 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.99
NefhP19246 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
NefhP19246 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
NefhP19246 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
NefhP19246 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
NefhP19246 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
NefhP19246 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
NefhP19246 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
NefhP19246 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
NefhP19246 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
NefhP19246 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
NefhP19246 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
NefhP19246 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
NefhP19246 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
NefhP19246 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
NefhP19246 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
NefhP19246 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
NefhP19246 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
NefhP19246 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
NefhP19246 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
NefhP19246 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
NefhP19246 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
NefhP19246 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
NefhP19246 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
NefhP19246 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
NefhP19246 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
NefhP19246 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
NefhP19246 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
NefhP19246 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
NefhP19246 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
NefhP19246 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
NefhP19246 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
NefhP19246 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
NefhP19246 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
NefhP19246 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
NefhP19246 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
NefhP19246 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
NefhP19246 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC27.33■■□□□ 1.97
NefhP19246 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
NefhP19246 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
NefhP19246 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45 ms