Protein–RNA interactions for Protein: P19123

Tnnc1, Troponin C, slow skeletal and cardiac muscles, mousemouse

Predictions only

Length 161 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnnc1P19123 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
Tnnc1P19123 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Tnnc1P19123 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Tnnc1P19123 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Tnnc1P19123 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Tnnc1P19123 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
Tnnc1P19123 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Tnnc1P19123 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Tnnc1P19123 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Tnnc1P19123 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Tnnc1P19123 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Tnnc1P19123 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Tnnc1P19123 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Tnnc1P19123 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Tnnc1P19123 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Tnnc1P19123 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Tnnc1P19123 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Tnnc1P19123 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Tnnc1P19123 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Tnnc1P19123 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Tnnc1P19123 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Tnnc1P19123 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Tnnc1P19123 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Tnnc1P19123 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Tnnc1P19123 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Tnnc1P19123 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Tnnc1P19123 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Tnnc1P19123 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Tnnc1P19123 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Tnnc1P19123 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Tnnc1P19123 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Tnnc1P19123 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Tnnc1P19123 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Tnnc1P19123 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Tnnc1P19123 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Tnnc1P19123 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Tnnc1P19123 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Tnnc1P19123 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Tnnc1P19123 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Tnnc1P19123 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Tnnc1P19123 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Tnnc1P19123 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Tnnc1P19123 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Tnnc1P19123 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Tnnc1P19123 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Tnnc1P19123 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Tnnc1P19123 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Tnnc1P19123 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Tnnc1P19123 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Tnnc1P19123 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Tnnc1P19123 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Tnnc1P19123 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Tnnc1P19123 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Tnnc1P19123 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Tnnc1P19123 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Tnnc1P19123 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Tnnc1P19123 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
Tnnc1P19123 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Tnnc1P19123 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Tnnc1P19123 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Tnnc1P19123 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Tnnc1P19123 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Tnnc1P19123 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Tnnc1P19123 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Tnnc1P19123 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Tnnc1P19123 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Tnnc1P19123 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Tnnc1P19123 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Tnnc1P19123 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Tnnc1P19123 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Tnnc1P19123 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Tnnc1P19123 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Tnnc1P19123 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Tnnc1P19123 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Tnnc1P19123 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Tnnc1P19123 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Tnnc1P19123 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Tnnc1P19123 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Tnnc1P19123 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Tnnc1P19123 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Tnnc1P19123 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Tnnc1P19123 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Tnnc1P19123 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Tnnc1P19123 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Tnnc1P19123 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Tnnc1P19123 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Tnnc1P19123 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Tnnc1P19123 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Tnnc1P19123 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Tnnc1P19123 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Tnnc1P19123 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Tnnc1P19123 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Tnnc1P19123 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Tnnc1P19123 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Tnnc1P19123 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Tnnc1P19123 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Tnnc1P19123 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Tnnc1P19123 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Tnnc1P19123 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
Tnnc1P19123 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.9 ms