Protein–RNA interactions for Protein: P18653

Rps6ka1, Ribosomal protein S6 kinase alpha-1, mousemouse

Predictions only

Length 724 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rps6ka1P18653 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Rps6ka1P18653 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Rps6ka1P18653 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Rps6ka1P18653 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Rps6ka1P18653 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Rps6ka1P18653 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Rps6ka1P18653 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Rps6ka1P18653 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Rps6ka1P18653 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Rps6ka1P18653 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Rps6ka1P18653 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Rps6ka1P18653 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Rps6ka1P18653 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Rps6ka1P18653 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Rps6ka1P18653 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Rps6ka1P18653 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
Rps6ka1P18653 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Rps6ka1P18653 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Rps6ka1P18653 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Rps6ka1P18653 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Rps6ka1P18653 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Rps6ka1P18653 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Rps6ka1P18653 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Rps6ka1P18653 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Rps6ka1P18653 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Rps6ka1P18653 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Rps6ka1P18653 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Rps6ka1P18653 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Rps6ka1P18653 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Rps6ka1P18653 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Rps6ka1P18653 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Rps6ka1P18653 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Rps6ka1P18653 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Rps6ka1P18653 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Rps6ka1P18653 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Rps6ka1P18653 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Rps6ka1P18653 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Rps6ka1P18653 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Rps6ka1P18653 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Rps6ka1P18653 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Rps6ka1P18653 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Rps6ka1P18653 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Rps6ka1P18653 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Rps6ka1P18653 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Rps6ka1P18653 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Rps6ka1P18653 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Rps6ka1P18653 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Rps6ka1P18653 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Rps6ka1P18653 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Rps6ka1P18653 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Rps6ka1P18653 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Rps6ka1P18653 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Rps6ka1P18653 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Rps6ka1P18653 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Rps6ka1P18653 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
Rps6ka1P18653 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Rps6ka1P18653 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Rps6ka1P18653 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Rps6ka1P18653 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Rps6ka1P18653 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Rps6ka1P18653 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Rps6ka1P18653 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Rps6ka1P18653 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Rps6ka1P18653 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Rps6ka1P18653 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
Rps6ka1P18653 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Rps6ka1P18653 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Rps6ka1P18653 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
Rps6ka1P18653 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Rps6ka1P18653 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Rps6ka1P18653 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Rps6ka1P18653 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Rps6ka1P18653 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Rps6ka1P18653 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Rps6ka1P18653 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Rps6ka1P18653 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Rps6ka1P18653 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Rps6ka1P18653 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Rps6ka1P18653 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Rps6ka1P18653 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Rps6ka1P18653 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Rps6ka1P18653 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Rps6ka1P18653 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Rps6ka1P18653 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Rps6ka1P18653 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Rps6ka1P18653 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Rps6ka1P18653 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
Rps6ka1P18653 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Rps6ka1P18653 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Rps6ka1P18653 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
Rps6ka1P18653 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Rps6ka1P18653 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
Rps6ka1P18653 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
Rps6ka1P18653 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
Rps6ka1P18653 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Rps6ka1P18653 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Rps6ka1P18653 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Rps6ka1P18653 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
Rps6ka1P18653 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Rps6ka1P18653 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.5 ms