Protein–RNA interactions for Protein: P15975

Usp53, Inactive ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 53, mousemouse

Predictions only

Length 1,069 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp53P15975 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Usp53P15975 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Usp53P15975 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC27.66■■■□□ 2.02
Usp53P15975 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
Usp53P15975 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Usp53P15975 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Usp53P15975 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Usp53P15975 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Usp53P15975 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC27.63■■■□□ 2.01
Usp53P15975 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Usp53P15975 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Usp53P15975 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Usp53P15975 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Usp53P15975 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Usp53P15975 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Usp53P15975 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
Usp53P15975 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Usp53P15975 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Usp53P15975 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC27.57■■■□□ 2
Usp53P15975 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Usp53P15975 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Usp53P15975 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Usp53P15975 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Usp53P15975 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
Usp53P15975 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
Usp53P15975 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Usp53P15975 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
Usp53P15975 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC27.51■■□□□ 1.99
Usp53P15975 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Usp53P15975 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
Usp53P15975 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Usp53P15975 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
Usp53P15975 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
Usp53P15975 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Usp53P15975 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Usp53P15975 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
Usp53P15975 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
Usp53P15975 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
Usp53P15975 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Usp53P15975 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
Usp53P15975 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Usp53P15975 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
Usp53P15975 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Usp53P15975 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Usp53P15975 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
Usp53P15975 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Usp53P15975 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Usp53P15975 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
Usp53P15975 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Usp53P15975 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
Usp53P15975 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
Usp53P15975 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Usp53P15975 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Usp53P15975 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Usp53P15975 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Usp53P15975 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Usp53P15975 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
Usp53P15975 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
Usp53P15975 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
Usp53P15975 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Usp53P15975 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Usp53P15975 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Usp53P15975 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
Usp53P15975 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Usp53P15975 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
Usp53P15975 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
Usp53P15975 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC27.29■■□□□ 1.96
Usp53P15975 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
Usp53P15975 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Usp53P15975 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Usp53P15975 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Usp53P15975 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Usp53P15975 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Usp53P15975 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
Usp53P15975 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Usp53P15975 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Usp53P15975 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Usp53P15975 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC27.27■■□□□ 1.96
Usp53P15975 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
Usp53P15975 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
Usp53P15975 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
Usp53P15975 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Usp53P15975 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Usp53P15975 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Usp53P15975 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
Usp53P15975 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Usp53P15975 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Usp53P15975 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
Usp53P15975 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
Usp53P15975 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
Usp53P15975 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Usp53P15975 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
Usp53P15975 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
Usp53P15975 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Usp53P15975 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Usp53P15975 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
Usp53P15975 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Usp53P15975 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Usp53P15975 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Usp53P15975 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.9 ms