Protein–RNA interactions for Protein: P15532

Nme1, Nucleoside diphosphate kinase A, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 152 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nme1P15532 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Nme1P15532 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Nme1P15532 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Nme1P15532 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Nme1P15532 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Nme1P15532 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Nme1P15532 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Nme1P15532 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Nme1P15532 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Nme1P15532 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Nme1P15532 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Nme1P15532 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Nme1P15532 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Nme1P15532 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Nme1P15532 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Nme1P15532 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Nme1P15532 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Nme1P15532 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Nme1P15532 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Nme1P15532 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Nme1P15532 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Nme1P15532 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Nme1P15532 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Nme1P15532 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Nme1P15532 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Nme1P15532 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Nme1P15532 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Nme1P15532 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
Nme1P15532 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Nme1P15532 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Nme1P15532 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Nme1P15532 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Nme1P15532 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Nme1P15532 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Nme1P15532 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Nme1P15532 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Nme1P15532 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Nme1P15532 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Nme1P15532 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Nme1P15532 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Nme1P15532 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Nme1P15532 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Nme1P15532 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Nme1P15532 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Nme1P15532 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Nme1P15532 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Nme1P15532 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
Nme1P15532 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Nme1P15532 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Nme1P15532 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Nme1P15532 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Nme1P15532 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Nme1P15532 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Nme1P15532 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
Nme1P15532 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Nme1P15532 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Nme1P15532 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Nme1P15532 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
Nme1P15532 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Nme1P15532 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Nme1P15532 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Nme1P15532 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Nme1P15532 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
Nme1P15532 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
Nme1P15532 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Nme1P15532 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Nme1P15532 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Nme1P15532 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Nme1P15532 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Nme1P15532 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Nme1P15532 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Nme1P15532 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Nme1P15532 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Nme1P15532 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Nme1P15532 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Nme1P15532 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Nme1P15532 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Nme1P15532 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Nme1P15532 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Nme1P15532 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Nme1P15532 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
Nme1P15532 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Nme1P15532 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Nme1P15532 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Nme1P15532 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Nme1P15532 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
Nme1P15532 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Nme1P15532 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Nme1P15532 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Nme1P15532 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Nme1P15532 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Nme1P15532 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Nme1P15532 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Nme1P15532 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Nme1P15532 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Nme1P15532 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Nme1P15532 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
Nme1P15532 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Nme1P15532 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Nme1P15532 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.1 ms