Protein–RNA interactions for Protein: P15499

Prph2, Peripherin-2, mousemouse

Predictions only

Length 346 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prph2P15499 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21,7■■□□□ 1,06
Prph2P15499 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC21,7■■□□□ 1,06
Prph2P15499 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21,69■■□□□ 1,06
Prph2P15499 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC21,69■■□□□ 1,06
Prph2P15499 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,68■■□□□ 1,06
Prph2P15499 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21,68■■□□□ 1,06
Prph2P15499 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC21,68■■□□□ 1,06
Prph2P15499 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,68■■□□□ 1,06
Prph2P15499 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC21,68■■□□□ 1,06
Prph2P15499 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,67■■□□□ 1,06
Prph2P15499 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC21,67■■□□□ 1,06
Prph2P15499 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,67■■□□□ 1,06
Prph2P15499 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC21,66■■□□□ 1,06
Prph2P15499 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21,66■■□□□ 1,06
Prph2P15499 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC21,66■■□□□ 1,06
Prph2P15499 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,66■■□□□ 1,06
Prph2P15499 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,65■■□□□ 1,06
Prph2P15499 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21,65■■□□□ 1,06
Prph2P15499 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,65■■□□□ 1,06
Prph2P15499 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC21,64■■□□□ 1,06
Prph2P15499 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC21,64■■□□□ 1,05
Prph2P15499 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC21,64■■□□□ 1,05
Prph2P15499 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,64■■□□□ 1,05
Prph2P15499 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,63■■□□□ 1,05
Prph2P15499 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21,63■■□□□ 1,05
Prph2P15499 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,63■■□□□ 1,05
Prph2P15499 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21,63■■□□□ 1,05
Prph2P15499 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,62■■□□□ 1,05
Prph2P15499 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC21,62■■□□□ 1,05
Prph2P15499 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC21,62■■□□□ 1,05
Prph2P15499 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21,62■■□□□ 1,05
Prph2P15499 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC21,61■■□□□ 1,05
Prph2P15499 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC21,61■■□□□ 1,05
Prph2P15499 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,61■■□□□ 1,05
Prph2P15499 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC21,61■■□□□ 1,05
Prph2P15499 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21,6■■□□□ 1,05
Prph2P15499 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC21,6■■□□□ 1,05
Prph2P15499 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,59■■□□□ 1,05
Prph2P15499 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,59■■□□□ 1,05
Prph2P15499 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,59■■□□□ 1,05
Prph2P15499 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,58■■□□□ 1,05
Prph2P15499 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21,58■■□□□ 1,05
Prph2P15499 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC21,58■■□□□ 1,05
Prph2P15499 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC21,58■■□□□ 1,05
Prph2P15499 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC21,58■■□□□ 1,04
Prph2P15499 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC21,58■■□□□ 1,04
Prph2P15499 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,57■■□□□ 1,04
Prph2P15499 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC21,57■■□□□ 1,04
Prph2P15499 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21,57■■□□□ 1,04
Prph2P15499 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21,57■■□□□ 1,04
Prph2P15499 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21,56■■□□□ 1,04
Prph2P15499 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC21,56■■□□□ 1,04
Prph2P15499 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC21,56■■□□□ 1,04
Prph2P15499 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC21,56■■□□□ 1,04
Prph2P15499 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21,56■■□□□ 1,04
Prph2P15499 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21,55■■□□□ 1,04
Prph2P15499 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC21,55■■□□□ 1,04
Prph2P15499 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC21,54■■□□□ 1,04
Prph2P15499 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,54■■□□□ 1,04
Prph2P15499 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC21,54■■□□□ 1,04
Prph2P15499 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC21,54■■□□□ 1,04
Prph2P15499 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,54■■□□□ 1,04
Prph2P15499 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21,54■■□□□ 1,04
Prph2P15499 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21,53■■□□□ 1,04
Prph2P15499 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC21,52■■□□□ 1,04
Prph2P15499 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC21,52■■□□□ 1,04
Prph2P15499 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21,52■■□□□ 1,03
Prph2P15499 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC21,51■■□□□ 1,03
Prph2P15499 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC21,51■■□□□ 1,03
Prph2P15499 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,51■■□□□ 1,03
Prph2P15499 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21,5■■□□□ 1,03
Prph2P15499 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC21,5■■□□□ 1,03
Prph2P15499 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21,5■■□□□ 1,03
Prph2P15499 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21,5■■□□□ 1,03
Prph2P15499 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC21,5■■□□□ 1,03
Prph2P15499 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,5■■□□□ 1,03
Prph2P15499 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,49■■□□□ 1,03
Prph2P15499 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,49■■□□□ 1,03
Prph2P15499 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21,49■■□□□ 1,03
Prph2P15499 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21,48■■□□□ 1,03
Prph2P15499 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,48■■□□□ 1,03
Prph2P15499 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,47■■□□□ 1,03
Prph2P15499 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,47■■□□□ 1,03
Prph2P15499 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC21,47■■□□□ 1,03
Prph2P15499 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC21,47■■□□□ 1,03
Prph2P15499 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC21,47■■□□□ 1,03
Prph2P15499 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21,47■■□□□ 1,03
Prph2P15499 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,46■■□□□ 1,03
Prph2P15499 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC21,46■■□□□ 1,03
Prph2P15499 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC21,45■■□□□ 1,02
Prph2P15499 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21,45■■□□□ 1,02
Prph2P15499 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,45■■□□□ 1,02
Prph2P15499 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC21,45■■□□□ 1,02
Prph2P15499 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,45■■□□□ 1,02
Prph2P15499 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,44■■□□□ 1,02
Prph2P15499 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21,44■■□□□ 1,02
Prph2P15499 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,43■■□□□ 1,02
Prph2P15499 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,43■■□□□ 1,02
Prph2P15499 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21,42■■□□□ 1,02
Prph2P15499 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21,41■■□□□ 1,02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21,2 ms