Protein–RNA interactions for Protein: P13405

Rb1, Retinoblastoma-associated protein, mousemouse

Predictions only

Length 921 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rb1P13405 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
Rb1P13405 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
Rb1P13405 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Rb1P13405 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Rb1P13405 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Rb1P13405 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
Rb1P13405 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Rb1P13405 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
Rb1P13405 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Rb1P13405 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Rb1P13405 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Rb1P13405 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Rb1P13405 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Rb1P13405 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Rb1P13405 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Rb1P13405 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Rb1P13405 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Rb1P13405 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Rb1P13405 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Rb1P13405 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Rb1P13405 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Rb1P13405 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
Rb1P13405 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
Rb1P13405 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Rb1P13405 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Rb1P13405 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Rb1P13405 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Rb1P13405 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Rb1P13405 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Rb1P13405 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
Rb1P13405 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Rb1P13405 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Rb1P13405 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Rb1P13405 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Rb1P13405 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Rb1P13405 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Rb1P13405 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Rb1P13405 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Rb1P13405 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Rb1P13405 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Rb1P13405 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
Rb1P13405 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Rb1P13405 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Rb1P13405 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Rb1P13405 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Rb1P13405 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Rb1P13405 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Rb1P13405 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Rb1P13405 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Rb1P13405 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Rb1P13405 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Rb1P13405 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Rb1P13405 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Rb1P13405 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Rb1P13405 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Rb1P13405 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Rb1P13405 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
Rb1P13405 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Rb1P13405 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Rb1P13405 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Rb1P13405 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Rb1P13405 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Rb1P13405 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Rb1P13405 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Rb1P13405 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Rb1P13405 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Rb1P13405 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Rb1P13405 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Rb1P13405 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Rb1P13405 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Rb1P13405 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
Rb1P13405 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Rb1P13405 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Rb1P13405 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
Rb1P13405 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Rb1P13405 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Rb1P13405 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Rb1P13405 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Rb1P13405 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Rb1P13405 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Rb1P13405 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Rb1P13405 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Rb1P13405 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Rb1P13405 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Rb1P13405 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Rb1P13405 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Rb1P13405 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Rb1P13405 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Rb1P13405 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Rb1P13405 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Rb1P13405 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Rb1P13405 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Rb1P13405 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Rb1P13405 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Rb1P13405 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Rb1P13405 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Rb1P13405 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Rb1P13405 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Rb1P13405 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Rb1P13405 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.5 ms