Protein–RNA interactions for Protein: P12979

Myog, Myogenin, mousemouse

Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MyogP12979 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
MyogP12979 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
MyogP12979 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
MyogP12979 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
MyogP12979 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
MyogP12979 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
MyogP12979 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
MyogP12979 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
MyogP12979 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
MyogP12979 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
MyogP12979 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
MyogP12979 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
MyogP12979 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
MyogP12979 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
MyogP12979 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
MyogP12979 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
MyogP12979 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
MyogP12979 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
MyogP12979 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
MyogP12979 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
MyogP12979 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
MyogP12979 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
MyogP12979 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
MyogP12979 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
MyogP12979 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
MyogP12979 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
MyogP12979 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
MyogP12979 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
MyogP12979 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
MyogP12979 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
MyogP12979 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
MyogP12979 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
MyogP12979 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
MyogP12979 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
MyogP12979 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
MyogP12979 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
MyogP12979 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
MyogP12979 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
MyogP12979 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
MyogP12979 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
MyogP12979 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
MyogP12979 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
MyogP12979 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
MyogP12979 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
MyogP12979 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
MyogP12979 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
MyogP12979 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
MyogP12979 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
MyogP12979 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
MyogP12979 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
MyogP12979 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
MyogP12979 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
MyogP12979 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
MyogP12979 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
MyogP12979 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
MyogP12979 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
MyogP12979 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
MyogP12979 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
MyogP12979 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
MyogP12979 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
MyogP12979 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
MyogP12979 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
MyogP12979 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
MyogP12979 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
MyogP12979 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
MyogP12979 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
MyogP12979 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
MyogP12979 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
MyogP12979 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
MyogP12979 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
MyogP12979 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
MyogP12979 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
MyogP12979 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
MyogP12979 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
MyogP12979 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
MyogP12979 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
MyogP12979 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
MyogP12979 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
MyogP12979 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
MyogP12979 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
MyogP12979 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
MyogP12979 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
MyogP12979 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
MyogP12979 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
MyogP12979 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
MyogP12979 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
MyogP12979 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
MyogP12979 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
MyogP12979 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
MyogP12979 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
MyogP12979 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
MyogP12979 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
MyogP12979 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
MyogP12979 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
MyogP12979 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
MyogP12979 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
MyogP12979 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
MyogP12979 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
MyogP12979 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
MyogP12979 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 202.7 ms