Protein–RNA interactions for Protein: P12813

Nr4a1, Nuclear receptor subfamily 4 group A member 1, mousemouse

Predictions only

Length 601 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nr4a1P12813 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Nr4a1P12813 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Nr4a1P12813 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Nr4a1P12813 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Nr4a1P12813 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Nr4a1P12813 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Nr4a1P12813 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Nr4a1P12813 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Nr4a1P12813 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Nr4a1P12813 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Nr4a1P12813 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Nr4a1P12813 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Nr4a1P12813 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Nr4a1P12813 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Nr4a1P12813 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Nr4a1P12813 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Nr4a1P12813 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Nr4a1P12813 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Nr4a1P12813 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Nr4a1P12813 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Nr4a1P12813 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Nr4a1P12813 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Nr4a1P12813 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
Nr4a1P12813 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Nr4a1P12813 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Nr4a1P12813 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Nr4a1P12813 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Nr4a1P12813 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Nr4a1P12813 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Nr4a1P12813 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Nr4a1P12813 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Nr4a1P12813 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Nr4a1P12813 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Nr4a1P12813 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Nr4a1P12813 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Nr4a1P12813 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Nr4a1P12813 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Nr4a1P12813 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Nr4a1P12813 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Nr4a1P12813 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Nr4a1P12813 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Nr4a1P12813 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Nr4a1P12813 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Nr4a1P12813 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Nr4a1P12813 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Nr4a1P12813 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Nr4a1P12813 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Nr4a1P12813 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Nr4a1P12813 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Nr4a1P12813 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Nr4a1P12813 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Nr4a1P12813 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Nr4a1P12813 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Nr4a1P12813 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
Nr4a1P12813 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Nr4a1P12813 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Nr4a1P12813 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Nr4a1P12813 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Nr4a1P12813 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Nr4a1P12813 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Nr4a1P12813 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Nr4a1P12813 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Nr4a1P12813 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
Nr4a1P12813 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
Nr4a1P12813 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Nr4a1P12813 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Nr4a1P12813 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Nr4a1P12813 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Nr4a1P12813 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Nr4a1P12813 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
Nr4a1P12813 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Nr4a1P12813 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Nr4a1P12813 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Nr4a1P12813 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Nr4a1P12813 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Nr4a1P12813 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Nr4a1P12813 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Nr4a1P12813 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Nr4a1P12813 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
Nr4a1P12813 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Nr4a1P12813 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Nr4a1P12813 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Nr4a1P12813 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Nr4a1P12813 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Nr4a1P12813 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Nr4a1P12813 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Nr4a1P12813 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Nr4a1P12813 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Nr4a1P12813 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Nr4a1P12813 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Nr4a1P12813 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Nr4a1P12813 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Nr4a1P12813 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Nr4a1P12813 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
Nr4a1P12813 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Nr4a1P12813 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Nr4a1P12813 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Nr4a1P12813 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Nr4a1P12813 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Nr4a1P12813 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.7 ms