Protein–RNA interactions for Protein: P12658

Calb1, Calbindin, mousemouse

Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Calb1P12658 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Calb1P12658 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Calb1P12658 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Calb1P12658 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Calb1P12658 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Calb1P12658 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Calb1P12658 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Calb1P12658 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Calb1P12658 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Calb1P12658 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Calb1P12658 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Calb1P12658 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Calb1P12658 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Calb1P12658 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Calb1P12658 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
Calb1P12658 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Calb1P12658 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Calb1P12658 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Calb1P12658 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Calb1P12658 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Calb1P12658 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Calb1P12658 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Calb1P12658 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Calb1P12658 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Calb1P12658 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Calb1P12658 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Calb1P12658 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Calb1P12658 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Calb1P12658 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Calb1P12658 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Calb1P12658 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Calb1P12658 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Calb1P12658 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Calb1P12658 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Calb1P12658 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Calb1P12658 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Calb1P12658 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
Calb1P12658 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Calb1P12658 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Calb1P12658 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Calb1P12658 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Calb1P12658 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Calb1P12658 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Calb1P12658 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Calb1P12658 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
Calb1P12658 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Calb1P12658 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Calb1P12658 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Calb1P12658 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
Calb1P12658 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
Calb1P12658 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Calb1P12658 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Calb1P12658 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Calb1P12658 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Calb1P12658 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Calb1P12658 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Calb1P12658 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Calb1P12658 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Calb1P12658 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Calb1P12658 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Calb1P12658 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Calb1P12658 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
Calb1P12658 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
Calb1P12658 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Calb1P12658 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Calb1P12658 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Calb1P12658 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
Calb1P12658 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Calb1P12658 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Calb1P12658 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Calb1P12658 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Calb1P12658 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
Calb1P12658 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Calb1P12658 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Calb1P12658 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Calb1P12658 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Calb1P12658 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Calb1P12658 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Calb1P12658 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Calb1P12658 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Calb1P12658 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Calb1P12658 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Calb1P12658 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Calb1P12658 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Calb1P12658 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Calb1P12658 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Calb1P12658 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Calb1P12658 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Calb1P12658 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Calb1P12658 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Calb1P12658 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Calb1P12658 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Calb1P12658 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Calb1P12658 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Calb1P12658 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Calb1P12658 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Calb1P12658 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Calb1P12658 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Calb1P12658 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Calb1P12658 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.4 ms