Protein–RNA interactions for Protein: P11798

Camk2a, Calcium/calmodulin-dependent protein kinase type II subunit alpha, mousemouse

Predictions only

Length 478 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Camk2aP11798 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Camk2aP11798 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Camk2aP11798 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Camk2aP11798 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Camk2aP11798 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Camk2aP11798 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Camk2aP11798 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Camk2aP11798 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Camk2aP11798 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Camk2aP11798 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Camk2aP11798 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Camk2aP11798 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Camk2aP11798 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Camk2aP11798 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Camk2aP11798 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Camk2aP11798 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Camk2aP11798 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Camk2aP11798 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Camk2aP11798 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Camk2aP11798 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Camk2aP11798 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Camk2aP11798 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Camk2aP11798 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Camk2aP11798 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Camk2aP11798 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Camk2aP11798 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Camk2aP11798 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Camk2aP11798 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Camk2aP11798 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Camk2aP11798 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Camk2aP11798 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Camk2aP11798 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Camk2aP11798 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Camk2aP11798 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Camk2aP11798 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Camk2aP11798 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Camk2aP11798 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Camk2aP11798 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Camk2aP11798 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Camk2aP11798 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Camk2aP11798 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Camk2aP11798 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Camk2aP11798 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Camk2aP11798 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Camk2aP11798 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Camk2aP11798 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Camk2aP11798 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Camk2aP11798 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Camk2aP11798 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Camk2aP11798 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Camk2aP11798 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Camk2aP11798 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Camk2aP11798 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Camk2aP11798 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Camk2aP11798 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Camk2aP11798 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Camk2aP11798 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Camk2aP11798 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Camk2aP11798 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Camk2aP11798 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Camk2aP11798 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Camk2aP11798 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Camk2aP11798 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Camk2aP11798 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Camk2aP11798 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Camk2aP11798 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Camk2aP11798 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.3■■□□□ 1
Camk2aP11798 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Camk2aP11798 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Camk2aP11798 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Camk2aP11798 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Camk2aP11798 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Camk2aP11798 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Camk2aP11798 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Camk2aP11798 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
Camk2aP11798 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Camk2aP11798 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Camk2aP11798 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Camk2aP11798 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Camk2aP11798 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Camk2aP11798 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Camk2aP11798 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Camk2aP11798 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Camk2aP11798 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Camk2aP11798 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Camk2aP11798 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Camk2aP11798 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Camk2aP11798 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Camk2aP11798 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
Camk2aP11798 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Camk2aP11798 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
Camk2aP11798 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Camk2aP11798 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Camk2aP11798 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Camk2aP11798 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Camk2aP11798 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
Camk2aP11798 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Camk2aP11798 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Camk2aP11798 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Camk2aP11798 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.3 ms