Protein–RNA interactions for Protein: P08775

Polr2a, DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,970 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Polr2aP08775 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Polr2aP08775 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Polr2aP08775 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Polr2aP08775 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC28.09■■■□□ 2.09
Polr2aP08775 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Polr2aP08775 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
Polr2aP08775 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC28.05■■■□□ 2.08
Polr2aP08775 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Polr2aP08775 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
Polr2aP08775 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Polr2aP08775 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Polr2aP08775 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Polr2aP08775 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
Polr2aP08775 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Polr2aP08775 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
Polr2aP08775 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Polr2aP08775 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Polr2aP08775 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Polr2aP08775 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
Polr2aP08775 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Polr2aP08775 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
Polr2aP08775 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Polr2aP08775 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC27.96■■■□□ 2.07
Polr2aP08775 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Polr2aP08775 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC27.95■■■□□ 2.07
Polr2aP08775 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
Polr2aP08775 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Polr2aP08775 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Polr2aP08775 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Polr2aP08775 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Polr2aP08775 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Polr2aP08775 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
Polr2aP08775 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Polr2aP08775 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Polr2aP08775 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC27.91■■■□□ 2.06
Polr2aP08775 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC27.91■■■□□ 2.06
Polr2aP08775 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Polr2aP08775 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
Polr2aP08775 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Polr2aP08775 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC27.9■■■□□ 2.06
Polr2aP08775 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Polr2aP08775 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Polr2aP08775 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
Polr2aP08775 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Polr2aP08775 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC27.88■■■□□ 2.05
Polr2aP08775 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Polr2aP08775 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Polr2aP08775 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Polr2aP08775 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
Polr2aP08775 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Polr2aP08775 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Polr2aP08775 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC27.87■■■□□ 2.05
Polr2aP08775 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Polr2aP08775 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Polr2aP08775 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
Polr2aP08775 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Polr2aP08775 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
Polr2aP08775 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
Polr2aP08775 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Polr2aP08775 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
Polr2aP08775 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Polr2aP08775 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Polr2aP08775 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Polr2aP08775 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Polr2aP08775 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Polr2aP08775 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Polr2aP08775 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC27.84■■■□□ 2.05
Polr2aP08775 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Polr2aP08775 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
Polr2aP08775 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Polr2aP08775 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Polr2aP08775 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
Polr2aP08775 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
Polr2aP08775 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
Polr2aP08775 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC27.81■■■□□ 2.04
Polr2aP08775 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Polr2aP08775 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC27.8■■■□□ 2.04
Polr2aP08775 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Polr2aP08775 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC27.8■■■□□ 2.04
Polr2aP08775 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
Polr2aP08775 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Polr2aP08775 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Polr2aP08775 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Polr2aP08775 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Polr2aP08775 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
Polr2aP08775 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Polr2aP08775 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
Polr2aP08775 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Polr2aP08775 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Polr2aP08775 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC27.76■■■□□ 2.03
Polr2aP08775 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Polr2aP08775 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC27.76■■■□□ 2.03
Polr2aP08775 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Polr2aP08775 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
Polr2aP08775 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
Polr2aP08775 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Polr2aP08775 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Polr2aP08775 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
Polr2aP08775 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Polr2aP08775 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.6 ms