Protein–RNA interactions for Protein: P08046

Egr1, Early growth response protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 533 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Egr1P08046 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Egr1P08046 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Egr1P08046 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Egr1P08046 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Egr1P08046 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Egr1P08046 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Egr1P08046 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Egr1P08046 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Egr1P08046 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Egr1P08046 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Egr1P08046 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Egr1P08046 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Egr1P08046 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Egr1P08046 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Egr1P08046 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Egr1P08046 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Egr1P08046 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Egr1P08046 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Egr1P08046 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Egr1P08046 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Egr1P08046 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Egr1P08046 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Egr1P08046 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Egr1P08046 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Egr1P08046 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Egr1P08046 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Egr1P08046 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Egr1P08046 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Egr1P08046 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Egr1P08046 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Egr1P08046 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Egr1P08046 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Egr1P08046 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Egr1P08046 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
Egr1P08046 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Egr1P08046 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
Egr1P08046 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Egr1P08046 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Egr1P08046 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Egr1P08046 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Egr1P08046 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
Egr1P08046 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Egr1P08046 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Egr1P08046 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Egr1P08046 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Egr1P08046 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Egr1P08046 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Egr1P08046 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
Egr1P08046 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Egr1P08046 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Egr1P08046 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Egr1P08046 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Egr1P08046 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Egr1P08046 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Egr1P08046 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Egr1P08046 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Egr1P08046 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Egr1P08046 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Egr1P08046 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Egr1P08046 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Egr1P08046 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Egr1P08046 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Egr1P08046 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Egr1P08046 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
Egr1P08046 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Egr1P08046 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Egr1P08046 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Egr1P08046 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Egr1P08046 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Egr1P08046 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Egr1P08046 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Egr1P08046 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Egr1P08046 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Egr1P08046 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Egr1P08046 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Egr1P08046 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Egr1P08046 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Egr1P08046 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
Egr1P08046 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
Egr1P08046 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Egr1P08046 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Egr1P08046 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Egr1P08046 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Egr1P08046 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Egr1P08046 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Egr1P08046 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Egr1P08046 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Egr1P08046 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Egr1P08046 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Egr1P08046 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Egr1P08046 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Egr1P08046 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Egr1P08046 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Egr1P08046 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Egr1P08046 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
Egr1P08046 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Egr1P08046 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Egr1P08046 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Egr1P08046 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Egr1P08046 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.2 ms