Protein–RNA interactions for Protein: P01837

Ig kappa chain C region, mousemouse

Predictions only

Length 106 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01837 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
P01837 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
P01837 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
P01837 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
P01837 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
P01837 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
P01837 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
P01837 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
P01837 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
P01837 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
P01837 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
P01837 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
P01837 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
P01837 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
P01837 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
P01837 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
P01837 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
P01837 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
P01837 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
P01837 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
P01837 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
P01837 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
P01837 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
P01837 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
P01837 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
P01837 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
P01837 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
P01837 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
P01837 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
P01837 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
P01837 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
P01837 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
P01837 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
P01837 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
P01837 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
P01837 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
P01837 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
P01837 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
P01837 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
P01837 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
P01837 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
P01837 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
P01837 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
P01837 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
P01837 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
P01837 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
P01837 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
P01837 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
P01837 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
P01837 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
P01837 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
P01837 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
P01837 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
P01837 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
P01837 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
P01837 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
P01837 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
P01837 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
P01837 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
P01837 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
P01837 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
P01837 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
P01837 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
P01837 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
P01837 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
P01837 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
P01837 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
P01837 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
P01837 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
P01837 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
P01837 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
P01837 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
P01837 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
P01837 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
P01837 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
P01837 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
P01837 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
P01837 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
P01837 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
P01837 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
P01837 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
P01837 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
P01837 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
P01837 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
P01837 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
P01837 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
P01837 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
P01837 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
P01837 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
P01837 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
P01837 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
P01837 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
P01837 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
P01837 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
P01837 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
P01837 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
P01837 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
P01837 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
P01837 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
P01837 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.2 ms