Protein–RNA interactions for Protein: P01657

Ig kappa chain V-III region PC 2413, mousemouse

Predictions only

Length 111 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01657 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
P01657 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
P01657 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
P01657 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
P01657 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
P01657 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
P01657 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
P01657 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
P01657 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
P01657 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
P01657 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
P01657 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
P01657 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
P01657 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
P01657 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
P01657 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
P01657 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
P01657 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
P01657 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
P01657 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
P01657 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
P01657 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
P01657 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
P01657 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
P01657 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
P01657 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
P01657 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
P01657 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
P01657 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
P01657 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
P01657 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
P01657 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
P01657 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
P01657 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
P01657 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
P01657 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
P01657 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
P01657 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
P01657 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
P01657 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
P01657 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
P01657 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
P01657 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
P01657 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
P01657 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
P01657 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
P01657 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
P01657 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
P01657 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
P01657 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
P01657 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
P01657 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
P01657 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
P01657 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
P01657 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
P01657 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
P01657 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
P01657 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
P01657 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
P01657 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
P01657 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
P01657 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
P01657 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
P01657 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
P01657 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
P01657 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
P01657 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
P01657 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
P01657 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
P01657 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
P01657 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
P01657 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
P01657 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
P01657 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
P01657 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
P01657 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
P01657 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
P01657 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
P01657 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
P01657 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
P01657 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
P01657 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
P01657 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
P01657 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
P01657 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
P01657 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
P01657 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
P01657 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
P01657 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
P01657 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
P01657 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
P01657 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
P01657 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
P01657 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
P01657 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
P01657 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
P01657 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
P01657 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
P01657 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
P01657 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 176.1 ms